論文の概要: Test Time Transform Prediction for Open Set Histopathological Image
Recognition
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2206.10033v1
- Date: Mon, 20 Jun 2022 22:39:48 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-06-22 16:56:37.260166
- Title: Test Time Transform Prediction for Open Set Histopathological Image
Recognition
- Title(参考訳): open set histopathological image recognitionにおけるテスト時間変換予測
- Authors: Adrian Galdran. Katherine J. Hewitt, Narmin L. Ghaffari, Jakob N.
Kather, Gustavo Carneiro, Miguel A. Gonz\'alez Ballester
- Abstract要約: 本稿では,画像カテゴリを正確に識別するモデルのトレーニングに基づく,オープンセットのヒストロジ的画像認識のための新しいアプローチを提案する。
テスト時間において、我々はこの変換を予測するためのモデル信頼度を測定し、オープンセットの画像に対してより低い値が期待できる。
組織像から大腸癌評価の文脈を総合的に検討した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.540822622379176
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Tissue typology annotation in Whole Slide histological images is a complex
and tedious, yet necessary task for the development of computational pathology
models. We propose to address this problem by applying Open Set Recognition
techniques to the task of jointly classifying tissue that belongs to a set of
annotated classes, e.g. clinically relevant tissue categories, while rejecting
in test time Open Set samples, i.e. images that belong to categories not
present in the training set. To this end, we introduce a new approach for Open
Set histopathological image recognition based on training a model to accurately
identify image categories and simultaneously predict which data augmentation
transform has been applied. In test time, we measure model confidence in
predicting this transform, which we expect to be lower for images in the Open
Set. We carry out comprehensive experiments in the context of colorectal cancer
assessment from histological images, which provide evidence on the strengths of
our approach to automatically identify samples from unknown categories. Code is
released at https://github.com/agaldran/t3po .
- Abstract(参考訳): 全体のスライド組織像における組織型分類は複雑で退屈で、計算病理モデルの開発に必要なタスクである。
本研究は, 臨床関連組織カテゴリなどの注釈付きクラスに属する組織を共同分類する作業に対して, オープンセット認識技術を適用し, テスト時間帯のオープンセットサンプル, トレーニングセットに存在しないカテゴリに属するイメージを拒絶することで, この問題に対処することを提案する。
そこで本研究では,画像カテゴリを正確に識別するモデルを訓練し,どのデータ拡張変換が適用されたかを同時に予測する手法を提案する。
テスト時間において、我々はこの変換を予測するためのモデル信頼度を測定し、オープンセットの画像に対してより低い値が期待できる。
病理組織学的画像から大腸癌評価の文脈において総合的な実験を行い,未知のカテゴリのサンプルを自動的に同定する手法の強みを示す。
コードはhttps://github.com/agaldran/t3poでリリースされる。
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