論文の概要: Adapting the Mean Teacher for keypoint-based lung registration under
geometric domain shifts
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2207.00371v1
- Date: Fri, 1 Jul 2022 12:16:42 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-07-04 18:06:16.339235
- Title: Adapting the Mean Teacher for keypoint-based lung registration under
geometric domain shifts
- Title(参考訳): 幾何学的領域シフト下におけるキーポイント型肺登録のための平均教師の適応
- Authors: Alexander Bigalke, Lasse Hansen, Mattias P. Heinrich
- Abstract要約: ディープニューラルネットワークは一般的に、ラベル付きトレーニングデータが多く必要であり、トレーニングデータとテストデータの間のドメインシフトに弱い。
本稿では,ラベル付きソースからラベル付きターゲットドメインへのモデルの適用により,画像登録のための幾何学的領域適応手法を提案する。
本手法は,ベースラインモデルの精度を目標データに適合させながら,ベースラインモデルの50%/47%を継続的に改善する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 75.51482952586773
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Recent deep learning-based methods for medical image registration achieve
results that are competitive with conventional optimization algorithms at
reduced run times. However, deep neural networks generally require plenty of
labeled training data and are vulnerable to domain shifts between training and
test data. While typical intensity shifts can be mitigated by keypoint-based
registration, these methods still suffer from geometric domain shifts, for
instance, due to different fields of view. As a remedy, in this work, we
present a novel approach to geometric domain adaptation for image registration,
adapting a model from a labeled source to an unlabeled target domain. We build
on a keypoint-based registration model, combining graph convolutions for
geometric feature learning with loopy belief optimization, and propose to
reduce the domain shift through self-ensembling. To this end, we embed the
model into the Mean Teacher paradigm. We extend the Mean Teacher to this
context by 1) adapting the stochastic augmentation scheme and 2) combining
learned feature extraction with differentiable optimization. This enables us to
guide the learning process in the unlabeled target domain by enforcing
consistent predictions of the learning student and the temporally averaged
teacher model. We evaluate the method for exhale-to-inhale lung CT registration
under two challenging adaptation scenarios (DIR-Lab 4D CT to COPD, COPD to
Learn2Reg). Our method consistently improves on the baseline model by 50%/47%
while even matching the accuracy of models trained on target data. Source code
is available at
https://github.com/multimodallearning/registration-da-mean-teacher.
- Abstract(参考訳): 近年の深層学習に基づく医用画像登録法は, 従来の最適化アルゴリズムと競合する結果が得られる。
しかし、ディープニューラルネットワークは通常、多くのラベル付きトレーニングデータを必要とし、トレーニングとテストデータの間のドメインシフトに弱い。
典型的な強度シフトはキーポイントベースの登録によって緩和できるが、これらの手法は、例えば異なる視野で幾何学的な領域シフトに悩まされている。
本研究では,ラベル付きソースからラベル付きターゲットドメインへのモデルの適用により,画像登録のための幾何学的領域適応に対する新しいアプローチを提案する。
幾何学的特徴学習のためのグラフ畳み込みとループ的信念最適化を組み合わせたキーポイントに基づく登録モデルを構築し,自己センシングによるドメインシフトの低減を提案する。
この目的のために、私たちはこのモデルを平均的な教師パラダイムに組み込む。
我々は平均教師をこの文脈に拡張する
1)確率的増補計画の適応、及び
2)学習した特徴抽出と微分可能な最適化を組み合わせる。
これにより、学習者の一貫した予測と時間平均教師モデルにより、ラベルのない対象領域での学習プロセスを導くことができる。
DIR-Lab 4D CT から COPD , COPD から Learn2Reg への2つの適応シナリオを用いて,吸入吸入肺CT 登録法の評価を行った。
本手法は,ベースラインモデルの精度を目標データに適合させながら,ベースラインモデルの50%/47%を継続的に改善する。
ソースコードはhttps://github.com/multimodallearning/registration-da-mean-teacherで入手できる。
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