論文の概要: Trichomonas Vaginalis Segmentation in Microscope Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2207.00973v1
- Date: Sun, 3 Jul 2022 07:29:05 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-07-05 14:35:42.859794
- Title: Trichomonas Vaginalis Segmentation in Microscope Images
- Title(参考訳): 顕微鏡画像における Trichomonas Vaginalis Segmentation
- Authors: Lin Li, Jingyi Liu, Shuo Wang, Xunkun Wang, Tian-Zhu Xiang
- Abstract要約: 顕微鏡画像からのTrichomonas vaginalisの自動検出は、Trichomoniasisの診断に重要な情報を提供することができる。
これらの課題に対処するため、我々はTrichomonas Vaginalisの大規模な顕微鏡画像データセット(TVMI3K)を精査した。
本稿では,Trichomonaを顕微鏡画像から自動的に分離する,シンプルで効果的なベースラインであるTVNetを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.432233734742143
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Trichomoniasis is a common infectious disease with high incidence caused by
the parasite Trichomonas vaginalis, increasing the risk of getting HIV in
humans if left untreated. Automated detection of Trichomonas vaginalis from
microscopic images can provide vital information for the diagnosis of
trichomoniasis. However, accurate Trichomonas vaginalis segmentation (TVS) is a
challenging task due to the high appearance similarity between the Trichomonas
and other cells (e.g., leukocyte), the large appearance variation caused by
their motility, and, most importantly, the lack of large-scale annotated data
for deep model training. To address these challenges, we elaborately collected
the first large-scale Microscopic Image dataset of Trichomonas Vaginalis, named
TVMI3K, which consists of 3,158 images covering Trichomonas of various
appearances in diverse backgrounds, with high-quality annotations including
object-level mask labels, object boundaries, and challenging attributes.
Besides, we propose a simple yet effective baseline, termed TVNet, to
automatically segment Trichomonas from microscopic images, including
high-resolution fusion and foreground-background attention modules. Extensive
experiments demonstrate that our model achieves superior segmentation
performance and outperforms various cutting-edge object detection models both
quantitatively and qualitatively, making it a promising framework to promote
future research in TVS tasks. The dataset and results will be publicly
available at: https://github.com/CellRecog/cellRecog.
- Abstract(参考訳): トリコモニア症(英: Trichomoniasis)は、寄生虫Trichomonas vaginalisによって引き起こされる高頻度の感染症であり、未治療でヒトにHIVを発症するリスクを増大させる。
顕微鏡画像からのtrichomonas vaginalisの自動検出は、trichomoniasisの診断に不可欠な情報を提供する。
しかし、正確なTrichomonas vaginalis segmentation(TVS)は、Trichomonasと他の細胞(例えば白血球)の外観の類似性の高さ、その運動性に起因する大きな外観の変化、そして最も重要なことに、深層モデルトレーニングのための大規模な注釈データがないため、難しい課題である。
これらの課題に対処するため,我々は,tvmi3kと呼ばれるtrichomonas vaginalisの最初の大規模顕微鏡画像データセットを精巧に収集した。
さらに,高分解能核融合や前景アテンションモジュールを含む顕微鏡画像から自動的にトリコモナを分離する,TVNetと呼ばれるシンプルなベースラインを提案する。
広範な実験により,本モデルはセグメンテーション性能に優れ,定量的および定性的に様々な最先端物体検出モデルを上回ることを証明し,今後のtvs課題研究の推進に有望な枠組みとなる。
データセットと結果は、https://github.com/CellRecog/cellRecog.comで公開される。
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