論文の概要: Robust Quantitative Susceptibility Mapping via Approximate Message
Passing
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2207.14709v1
- Date: Fri, 29 Jul 2022 14:38:03 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-08-01 13:18:00.096350
- Title: Robust Quantitative Susceptibility Mapping via Approximate Message
Passing
- Title(参考訳): 近似メッセージパッシングによるロバストな定量的サセプティビリティマッピング
- Authors: Shuai Huang, James J. Lah, Jason W. Allen, Deqiang Qiu
- Abstract要約: 位相誤差の存在下でQSMを回復することは困難である。
AMP-PEは、最先端の非線形L1-QSMおよびMEDIアプローチと比較される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 14.22930572798757
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Purpose: It has been challenging to recover QSM in the presence of phase
errors, which could be caused by the noise or strong local susceptibility
shifts in cases of brain hemorrhage and calcification. We propose a Bayesian
formulation for QSM where a two-component Gaussian-mixture distribution is used
to model the long-tailed noise (error) distribution, and design an approximate
message passing (AMP) algorithm with automatic and adaptive parameter
estimation.
Theory: Wavelet coefficients of the susceptibility map follow the Laplace
distribution. The measurement noise follows a two-component Gaussian-mixture
distribution where the second Gaussian component models the noise outliers. The
distribution parameters are treated as unknown variables and jointly recovered
with the susceptibility using AMP.
Methods: The proposed AMP with parameter estimation (AMP-PE) is compared with
the state-of-the-art nonlinear L1-QSM and MEDI approaches that adopt the
L1-norm and L2-norm data-fidelity terms respectively. The three approaches are
tested on the Sim2Snr1 data from QSM challenge 2.0, the in vivo data from both
healthy and hemorrhage scans.
Results: On the simulated Sim2Snr1 dataset, AMP-PE achieved the lowest NRMSE
and SSIM, MEDI achieved the lowest HFEN, and each approach also has its own
strong suit when it comes to various local evaluation metrics. On the in vivo
dataset, AMP-PE is better at preserving structural details and removing
streaking artifacts than L1-QSM and MEDI.
Conclusion: By leveraging a customized Gaussian-mixture noise prior, AMP-PE
achieves better performance on the challenging QSM cases involving hemorrhage
and calcification. It is equipped with built-in parameter estimation, which
avoids subjective bias from the usual visual fine-tuning step of in vivo
reconstruction.
- Abstract(参考訳): 目的: 脳出血や石灰化の場合には, 雑音や強い局所感受性の変化によって引き起こされる位相誤差の存在下でQSMを回復することは困難である。
本稿では,2成分のガウス混合分布を用いて長周期雑音(エラー)分布をモデル化したQSMのベイズ的定式化と,自動および適応パラメータ推定による近似メッセージパッシング(AMP)アルゴリズムの設計を行う。
理論: 感受性写像のウェーブレット係数はラプラス分布に従う。
測定ノイズは、第2ガウス成分がノイズ外れ値をモデル化する2成分ガウス混合分布に従う。
分布パラメータは未知の変数として扱われ、AMPを用いて感受性とともに復元される。
手法: パラメータ推定を用いたAMP(AMP-PE)は,L1-normとL2-normのデータフィデリティ項をそれぞれ適用した,最先端の非線形L1-QSMおよびMEDIアプローチと比較する。
3つのアプローチは、qsm challenge 2.0のsim2snr1データ、健康診断と出血検査の両方のin vivoデータでテストされた。
結果:シミュレートされたSim2Snr1データセットでは,AMP-PEが最も低いNRMSEとSSIMを達成し,MEDIは最も低いHFENを達成した。
in vivoデータセットでは、AMP-PEは構造の詳細を保存し、L1-QSMやMEDIよりもストリーキングアーティファクトを除去する。
結語:前述したガウス混合雑音を利用して, AMP-PEは出血や石灰化を伴うQSM症例において, より優れた性能を発揮する。
生体内再構成の通常の視覚微調整ステップから主観バイアスを回避できる組み込みパラメータ推定機能を備えている。
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