論文の概要: A Pathologist-Informed Workflow for Classification of Prostate Glands in
Histopathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2209.13408v1
- Date: Tue, 27 Sep 2022 14:08:19 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-28 15:16:18.279910
- Title: A Pathologist-Informed Workflow for Classification of Prostate Glands in
Histopathology
- Title(参考訳): 病理組織学における前立腺の分類のための病理情報ワークフロー
- Authors: Alessandro Ferrero, Beatrice Knudsen, Deepika Sirohi, Ross Whitaker
- Abstract要約: 病理学者は、ガラススライド上の針生検の組織を調べて前立腺がんを診断し、診断する。
がんの重症度と転移リスクは、前立腺の組織と形態に基づくスコアであるGleason gradeによって決定される。
本稿では,病理学者のtextitmodus operandi に従って,個々の腺のマルチスケールパッチを分離・分類する自動ワークフローを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 62.997667081978825
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Pathologists diagnose and grade prostate cancer by examining tissue from
needle biopsies on glass slides. The cancer's severity and risk of metastasis
are determined by the Gleason grade, a score based on the organization and
morphology of prostate cancer glands. For diagnostic work-up, pathologists
first locate glands in the whole biopsy core, and -- if they detect cancer --
they assign a Gleason grade. This time-consuming process is subject to errors
and significant inter-observer variability, despite strict diagnostic criteria.
This paper proposes an automated workflow that follows pathologists'
\textit{modus operandi}, isolating and classifying multi-scale patches of
individual glands in whole slide images (WSI) of biopsy tissues using distinct
steps: (1) two fully convolutional networks segment epithelium versus stroma
and gland boundaries, respectively; (2) a classifier network separates benign
from cancer glands at high magnification; and (3) an additional classifier
predicts the grade of each cancer gland at low magnification. Altogether, this
process provides a gland-specific approach for prostate cancer grading that we
compare against other machine-learning-based grading methods.
- Abstract(参考訳): 病理学者は、ガラススライド上の針生検から組織を調べることで前立腺癌の診断と診断を行う。
がんの重症度と転移リスクは、前立腺の組織と形態に基づくスコアであるGleason gradeによって決定される。
診断作業のために、病理学者はまず、生検コア全体の腺を見つけ、がんを検出するとグリーソングレードを割り当てる。
この時間を要するプロセスは、厳格な診断基準にもかかわらず、エラーとサーバ間の大きなばらつきが伴う。
This paper proposes an automated workflow that follows pathologists' \textit{modus operandi}, isolating and classifying multi-scale patches of individual glands in whole slide images (WSI) of biopsy tissues using distinct steps: (1) two fully convolutional networks segment epithelium versus stroma and gland boundaries, respectively; (2) a classifier network separates benign from cancer glands at high magnification; and (3) an additional classifier predicts the grade of each cancer gland at low magnification.
このプロセスは、他の機械学習ベースのグレーティング手法と比較して、前立腺がんのグレーディングに腺特異的なアプローチを提供する。
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