論文の概要: Automated Quality Controlled Analysis of 2D Phase Contrast
Cardiovascular Magnetic Resonance Imaging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2209.14212v1
- Date: Wed, 28 Sep 2022 16:37:35 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-29 18:05:15.245198
- Title: Automated Quality Controlled Analysis of 2D Phase Contrast
Cardiovascular Magnetic Resonance Imaging
- Title(参考訳): 2次元位相コントラスト心筋磁気共鳴画像の自動品質制御解析
- Authors: Emily Chan, Ciaran O'Hanlon, Carlota Asegurado Marquez, Marwenie
Petalcorin, Jorge Mariscal-Harana, Haotian Gu, Raymond J. Kim, Robert M.
Judd, Phil Chowienczyk, Julia A. Schnabel, Reza Razavi, Andrew P. King, Bram
Ruijsink, Esther Puyol-Ant\'on
- Abstract要約: 位相コントラスト心磁気共鳴画像(PC-CMR)を用いた流れ解析
完全CMRスキャンからのフローの完全自動解析のための新しいディープラーニングベースのフレームワークを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.189751467114811
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Flow analysis carried out using phase contrast cardiac magnetic resonance
imaging (PC-CMR) enables the quantification of important parameters that are
used in the assessment of cardiovascular function. An essential part of this
analysis is the identification of the correct CMR views and quality control
(QC) to detect artefacts that could affect the flow quantification. We propose
a novel deep learning based framework for the fully-automated analysis of flow
from full CMR scans that first carries out these view selection and QC steps
using two sequential convolutional neural networks, followed by automatic aorta
and pulmonary artery segmentation to enable the quantification of key flow
parameters. Accuracy values of 0.958 and 0.914 were obtained for view
classification and QC, respectively. For segmentation, Dice scores were
$>$0.969 and the Bland-Altman plots indicated excellent agreement between
manual and automatic peak flow values. In addition, we tested our pipeline on
an external validation data set, with results indicating good robustness of the
pipeline. This work was carried out using multivendor clinical data consisting
of 986 cases, indicating the potential for the use of this pipeline in a
clinical setting.
- Abstract(参考訳): 位相コントラスト心磁気共鳴画像(PC-CMR)を用いた血流解析により、心血管機能評価に使用される重要なパラメータの定量化が可能となる。
この分析の重要な部分は、流れの定量化に影響を与える人工物を検出するための正しいCMRビューと品質制御(QC)を特定することである。
本稿では,2つの逐次畳み込みニューラルネットワークを用いた全CMRスキャンからのフローの完全自動解析とQCステップ,次いで自動大動脈と肺動脈セグメンテーションによるキーフローパラメータの定量化を提案する。
ビュー分類では0.958および0.914の精度値が得られた。
diceスコアは$0.969で、bland-altmanプロットは手動と自動的なピークフロー値に優れた一致を示した。
さらに,外部検証データセット上でパイプラインをテストした結果,パイプラインの堅牢性が示された。
本研究は,986例からなる多施設臨床データを用いて実施し,このパイプラインを臨床現場で活用する可能性を示唆した。
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