論文の概要: Reducing Positional Variance in Cross-sectional Abdominal CT Slices with
Deep Conditional Generative Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2209.14467v1
- Date: Wed, 28 Sep 2022 23:13:06 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-30 17:56:28.697478
- Title: Reducing Positional Variance in Cross-sectional Abdominal CT Slices with
Deep Conditional Generative Models
- Title(参考訳): 深部条件生成モデルを用いた腹部ctスライスにおける位置ばらつきの低減
- Authors: Xin Yu, Qi Yang, Yucheng Tang, Riqiang Gao, Shunxing Bao, LeonY. Cai,
Ho Hin Lee, Yuankai Huo, Ann Zenobia Moore, Luigi Ferrucci, Bennett A.
Landman
- Abstract要約: 2D低用量腹部CTスライスにより,体組成の直接測定が可能となった。
2次元腹部スライスを用いた体組成変化の経時的解析は,異なる年で得られた縦スライスの位置差により困難である。
我々は条件生成モデルをC-SliceGenに拡張し、腹部領域の任意の軸スライスを条件として、定義された椎骨レベルスライスを生成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 21.162780923697653
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: 2D low-dose single-slice abdominal computed tomography (CT) slice enables
direct measurements of body composition, which are critical to quantitatively
characterizing health relationships on aging. However, longitudinal analysis of
body composition changes using 2D abdominal slices is challenging due to
positional variance between longitudinal slices acquired in different years. To
reduce the positional variance, we extend the conditional generative models to
our C-SliceGen that takes an arbitrary axial slice in the abdominal region as
the condition and generates a defined vertebral level slice by estimating the
structural changes in the latent space. Experiments on 1170 subjects from an
in-house dataset and 50 subjects from BTCV MICCAI Challenge 2015 show that our
model can generate high quality images in terms of realism and similarity.
External experiments on 20 subjects from the Baltimore Longitudinal Study of
Aging (BLSA) dataset that contains longitudinal single abdominal slices
validate that our method can harmonize the slice positional variance in terms
of muscle and visceral fat area. Our approach provides a promising direction of
mapping slices from different vertebral levels to a target slice to reduce
positional variance for single slice longitudinal analysis. The source code is
available at: https://github.com/MASILab/C-SliceGen.
- Abstract(参考訳): 2D低用量腹部CTスライスにより, 身体組成の直接測定が可能であり, 加齢に伴う健康関係を定量的に評価することが重要である。
しかし, 2次元腹部スライスを用いた体組成変化の経時的解析は, 経年変化による位置的変化により困難である。
位置差を低減するため, 腹部領域の任意の軸スライスを条件として用いた条件生成モデルをC-SliceGenに拡張し, 潜伏空間の構造変化を推定し, 定義された椎骨レベルスライスを生成する。
BTCV MICCAI Challenge 2015では、社内データセットから1170名、BTCV MICCAI Challenge 2015から50名を対象に実験を行い、現実性と類似性の観点から高品質な画像を生成することができた。
経時的単腹部スライスを含むボルチモア縦断的老化研究(BLSA)データセットから得られた20名の被験者の外部的実験から, 筋および内臓脂肪面積のスライス位置の分散を調和させることが確認できた。
本手法は, 異なる脊椎レベルから標的スライスへのスライスマッピングの有望な方向を提供し, 単一スライス縦断解析における位置差を低減する。
ソースコードはhttps://github.com/masilab/c-slicegen。
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