論文の概要: Self-training of Machine Learning Models for Liver Histopathology:
Generalization under Clinical Shifts
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2211.07692v1
- Date: Mon, 14 Nov 2022 19:10:20 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-16 14:43:31.251583
- Title: Self-training of Machine Learning Models for Liver Histopathology:
Generalization under Clinical Shifts
- Title(参考訳): 肝病理学における機械学習モデルの自己学習--臨床シフト下での一般化
- Authors: Jin Li, Deepta Rajan, Chintan Shah, Dinkar Juyal, Shreya Chakraborty,
Chandan Akiti, Filip Kos, Janani Iyer, Anand Sampat, Ali Behrooz
- Abstract要約: 非アルコール性脂肪肝炎(NASH)に対する教師による自己学習システムの設計について,アノテーションを限定した臨床病理組織学的データセットを用いて検討した。
自己学習を通じて、最高の学生モデルは、マクロF1スコアに対して3%の絶対差で統計的に教師より優れていることを実証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.952117170419164
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Histopathology images are gigapixel-sized and include features and
information at different resolutions. Collecting annotations in histopathology
requires highly specialized pathologists, making it expensive and
time-consuming. Self-training can alleviate annotation constraints by learning
from both labeled and unlabeled data, reducing the amount of annotations
required from pathologists. We study the design of teacher-student
self-training systems for Non-alcoholic Steatohepatitis (NASH) using clinical
histopathology datasets with limited annotations. We evaluate the models on
in-distribution and out-of-distribution test data under clinical data shifts.
We demonstrate that through self-training, the best student model statistically
outperforms the teacher with a $3\%$ absolute difference on the macro F1 score.
The best student model also approaches the performance of a fully supervised
model trained with twice as many annotations.
- Abstract(参考訳): 病理像はギガピクセルサイズであり、解像度の異なる特徴や情報を含んでいる。
病理学における注釈の収集には高度に専門的な病理学者が必要であり、高価で時間を要する。
自己学習はラベル付きデータとラベルなしデータの両方から学習することでアノテーション制約を緩和し、病理医に必要なアノテーションの量を削減できる。
非アルコール性脂肪肝炎(NASH)に対する臨床病理組織学的データセットを用いた教師学習型自己訓練システムの設計について検討した。
臨床データシフト下での分布内および分布外テストデータに関するモデルを評価する。
自己学習を通じて、最高の学生モデルは、マクロF1スコアに対して3倍%の絶対差で統計的に教師より優れていることを示した。
最高の学生モデルは、また2倍のアノテーションで訓練された完全に教師されたモデルのパフォーマンスにもアプローチします。
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