論文の概要: Artificial Intelligence-based Eosinophil Counting in Gastrointestinal
Biopsies
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2211.15667v1
- Date: Fri, 25 Nov 2022 07:18:28 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-30 17:59:17.071491
- Title: Artificial Intelligence-based Eosinophil Counting in Gastrointestinal
Biopsies
- Title(参考訳): 消化器生検における人工知能による好酸球数測定
- Authors: Harsh Shah, Thomas Jacob, Amruta Parulekar, Anjali Amarapurkar, Amit
Sethi
- Abstract要約: 正常な好酸球は、健康な人の消化管(GI)に存在している。
好酸球が通常量を超えると、患者は様々な症状を経験する。
病理組織学はこの疾患の診断における金の基準である。
本研究では,GI tract biopsies における好酸球の検出と数を測定するために,UNet に基づくディープニューラルネットワークの訓練と試験を行った。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.7869681025240884
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Normally eosinophils are present in the gastrointestinal (GI) tract of
healthy individuals. When the eosinophils increase beyond their usual amount in
the GI tract, a patient gets varied symptoms. Clinicians find it difficult to
diagnose this condition called eosinophilia. Early diagnosis can help in
treating patients. Histopathology is the gold standard in the diagnosis for
this condition. As this is an under-diagnosed condition, counting eosinophils
in the GI tract biopsies is important. In this study, we trained and tested a
deep neural network based on UNet to detect and count eosinophils in GI tract
biopsies. We used connected component analysis to extract the eosinophils. We
studied correlation of eosinophilic infiltration counted by AI with a manual
count. GI tract biopsy slides were stained with H&E stain. Slides were scanned
using a camera attached to a microscope and five high-power field images were
taken per slide. Pearson correlation coefficient was 85% between the
machine-detected and manual eosinophil counts on 300 held-out (test) images.
- Abstract(参考訳): 通常、好酸球は健康な人の消化管(gi)に存在する。
好酸球が通常の消化管の量を超えると、患者はさまざまな症状を呈する。
臨床医はこの症状を好酸球症(eosinophilia)と診断することは困難である。
早期診断は患者の治療に役立つ。
病理組織学はこの疾患の診断における金の基準である。
これは未診断の状態であるため、GIの生検で好酸球を数えることが重要である。
本研究では, unetに基づく深層ニューラルネットワークを訓練し, 消化管生検における好酸球の検出と測定を行った。
共役成分分析を用いて好酸球を抽出した。
aiによる好酸球浸潤とマニュアルカウントとの相関について検討した。
尿路生検スライドにh&e染色を施した。
スライドは顕微鏡に取り付けられたカメラでスキャンされ、スライドごとに5つの高出力フィールド画像が撮影された。
パーソン相関係数は,300点画像上での機械検出と手動好酸球数の85%であった。
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