論文の概要: Adaptive Sequential Surveillance with Network and Temporal Dependence
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2212.02422v1
- Date: Mon, 5 Dec 2022 17:04:17 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-06 18:44:02.555399
- Title: Adaptive Sequential Surveillance with Network and Temporal Dependence
- Title(参考訳): ネットワークと時間依存を考慮した適応型シーケンシャルサーベイランス
- Authors: Ivana Malenica and Jeremy R. Coyle and Mark J. van der Laan and Maya
L. Petersen
- Abstract要約: 戦略的なテストアロケーションは、パンデミックと既存のパンデミックの両方のコントロールにおいて重要な役割を果たしている。
感染症の監視は、ユニークな統計上の課題を提示する。
適応型シーケンシャル監視のためのオンライン・スーパーラーナーを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.7205106391379026
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Strategic test allocation plays a major role in the control of both emerging
and existing pandemics (e.g., COVID-19, HIV). Widespread testing supports
effective epidemic control by (1) reducing transmission via identifying cases,
and (2) tracking outbreak dynamics to inform targeted interventions. However,
infectious disease surveillance presents unique statistical challenges. For
instance, the true outcome of interest - one's positive infectious status, is
often a latent variable. In addition, presence of both network and temporal
dependence reduces the data to a single observation. As testing entire
populations regularly is neither efficient nor feasible, standard approaches to
testing recommend simple rule-based testing strategies (e.g., symptom based,
contact tracing), without taking into account individual risk. In this work, we
study an adaptive sequential design involving n individuals over a period of
{\tau} time-steps, which allows for unspecified dependence among individuals
and across time. Our causal target parameter is the mean latent outcome we
would have obtained after one time-step, if, starting at time t given the
observed past, we had carried out a stochastic intervention that maximizes the
outcome under a resource constraint. We propose an Online Super Learner for
adaptive sequential surveillance that learns the optimal choice of tests
strategies over time while adapting to the current state of the outbreak.
Relying on a series of working models, the proposed method learns across
samples, through time, or both: based on the underlying (unknown) structure in
the data. We present an identification result for the latent outcome in terms
of the observed data, and demonstrate the superior performance of the proposed
strategy in a simulation modeling a residential university environment during
the COVID-19 pandemic.
- Abstract(参考訳): 戦略的なテスト割り当ては、パンデミックと既存のパンデミック(例えば、COVID-19、HIV)の制御において重要な役割を果たしている。
ワイドスプレッドテストは,(1)特定症例による感染抑制,(2)標的介入を通知するアウトブレイクダイナミクスの追跡による効果的な流行抑制を支援する。
しかし、感染症の監視には独特の統計上の課題がある。
例えば、関心の真の結果、すなわち陽性の感染状態は、しばしば潜伏変数である。
さらに、ネットワークと時間的依存の両方の存在は、データを単一の観測に還元する。
集団全体を定期的に検査することは効率的でも実現可能でもないので、テストの標準的なアプローチは、個々のリスクを考慮せずに、単純なルールベースのテスト戦略(症状ベース、接触追跡など)を推奨する。
そこで本研究では,n個の個人が時間ステップを経る適応的な逐次設計法について検討し,個人間の不特定な依存を可能とした。
我々の因果的目標パラメータは、ある時間ステップの後に得られる平均潜在結果であり、観測された過去が与えられたとき、資源制約の下で結果を最大化する確率的介入を実行していた場合である。
本研究では,流行状況に適応しながら,テスト戦略の最適選択を時間とともに学習する,適応型シーケンシャル監視のためのオンラインスーパーラーナーを提案する。
提案手法は一連の動作モデルに基づいて,データの基盤となる(未知)構造に基づいて,サンプル全体,時間的,あるいはその両方について学習する。
本研究は, 新型コロナウイルスのパンデミック時の住宅大学環境をモデル化するシミュレーションにおいて, 観測データの観点からの潜在結果の同定結果を示し, 提案手法の優れた性能を示す。
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