論文の概要: DeepCOVID-Fuse: A Multi-modality Deep Learning Model Fusing Chest
X-Radiographs and Clinical Variables to Predict COVID-19 Risk Levels
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2301.08798v1
- Date: Fri, 20 Jan 2023 20:54:25 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-01-24 16:25:10.548884
- Title: DeepCOVID-Fuse: A Multi-modality Deep Learning Model Fusing Chest
X-Radiographs and Clinical Variables to Predict COVID-19 Risk Levels
- Title(参考訳): DeepCOVID-Fuse: 胸部X線写真と臨床変数を併用した多モード深層学習モデル
- Authors: Yunan Wu, Amil Dravid, Ramsey Michael Wehbe, Aggelos K. Katsaggelos
- Abstract要約: DeepCOVID-Fuseは、新型コロナウイルス患者のリスクレベルを予測するディープラーニング融合モデルである。
CXRと臨床変数で訓練されたDeepCOVID-Fuseの精度は0.658であり、AUCは0.842である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.593516170110203
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Propose: To present DeepCOVID-Fuse, a deep learning fusion model to predict
risk levels in patients with confirmed coronavirus disease 2019 (COVID-19) and
to evaluate the performance of pre-trained fusion models on full or partial
combination of chest x-ray (CXRs) or chest radiograph and clinical variables.
Materials and Methods: The initial CXRs, clinical variables and outcomes
(i.e., mortality, intubation, hospital length of stay, ICU admission) were
collected from February 2020 to April 2020 with reverse-transcription
polymerase chain reaction (RT-PCR) test results as the reference standard. The
risk level was determined by the outcome. The fusion model was trained on 1657
patients (Age: 58.30 +/- 17.74; Female: 807) and validated on 428 patients
(56.41 +/- 17.03; 190) from Northwestern Memorial HealthCare system and was
tested on 439 patients (56.51 +/- 17.78; 205) from a single holdout hospital.
Performance of pre-trained fusion models on full or partial modalities were
compared on the test set using the DeLong test for the area under the receiver
operating characteristic curve (AUC) and the McNemar test for accuracy,
precision, recall and F1.
Results: The accuracy of DeepCOVID-Fuse trained on CXRs and clinical
variables is 0.658, with an AUC of 0.842, which significantly outperformed (p <
0.05) models trained only on CXRs with an accuracy of 0.621 and AUC of 0.807
and only on clinical variables with an accuracy of 0.440 and AUC of 0.502. The
pre-trained fusion model with only CXRs as input increases accuracy to 0.632
and AUC to 0.813 and with only clinical variables as input increases accuracy
to 0.539 and AUC to 0.733.
Conclusion: The fusion model learns better feature representations across
different modalities during training and achieves good outcome predictions even
when only some of the modalities are used in testing.
- Abstract(参考訳): 目的:DeepCOVID-Fuseは、2019年新型コロナウイルス感染症(COVID-19)患者のリスクレベルを予測するディープラーニング融合モデルであり、胸部X線(CXR)と胸部X線(CXR)と臨床変数の完全または部分組み合わせによる事前学習融合モデルの性能を評価する。
材料と方法:2020年2月から2020年4月にかけて, 初期CXR, 臨床変数, 成績(死亡, 挿管, 入院期間, ICU入院)を基準基準として, 逆転写ポリメラーゼ鎖反応 (RT-PCR) 試験結果を収集した。
リスクレベルは結果によって決定された。
融合モデルは1657人の患者(年齢:58.30 +/- 17.74、女性:807)に訓練され、ノースウェスタン記念医療システムから428人の患者(56.41 +/- 17.03; 190)に検証され、1つのホールドアウト病院から439人の患者(56.51 +/- 17.78; 205)に試験された。
実測値, 精度, 精度, リコール値およびF1に対するMcNemar試験と, 受信機動作特性曲線(AUC)の領域に対するDeLong試験を用いて, 実測値および部分変調値に対する事前学習型核融合モデルの性能を比較した。
結果: CXRと臨床変数で訓練されたDeepCOVID-Fuseの精度は0.658であり, AUCは0.842であり, CXRで訓練されたモデルでは0.621, AUCは0.807, 臨床変数では0.440, AUCは0.502であった。
CXRのみを入力とする予訓練核融合モデルでは精度が0.632、AUCが0.813、臨床変数のみが0.539、AUCが0.733となる。
結論: 融合モデルは、トレーニング中に異なるモダリティを越えてより良い特徴表現を学習し、テストでいくつかのモダリティしか使われなくても良い結果を予測する。
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