論文の概要: Computationally Efficient 3D MRI Reconstruction with Adaptive MLP
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2301.08868v2
- Date: Wed, 31 May 2023 15:34:02 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-02 03:28:51.791998
- Title: Computationally Efficient 3D MRI Reconstruction with Adaptive MLP
- Title(参考訳): 適応型MLPを用いた3次元MRI画像再構成
- Authors: Eric Z. Chen, Chi Zhang, Xiao Chen, Yikang Liu, Terrence Chen, Shanhui
Sun
- Abstract要約: 現在の手法は主に、小さなカーネルを持つ畳み込みニューラルネットワーク(CNN)に基づいている。
本稿では,低周波再構成用CNNモジュールと大周波再構成用GPU(MLP)モジュールのハイブリッドとしてRecon3DMLPを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.796051051794024
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Compared with 2D MRI, 3D MRI provides superior volumetric spatial resolution
and signal-to-noise ratio. However, it is more challenging to reconstruct 3D
MRI images. Current methods are mainly based on convolutional neural networks
(CNN) with small kernels, which are difficult to scale up to have sufficient
fitting power for 3D MRI reconstruction due to the large image size and GPU
memory constraint. Furthermore, MRI reconstruction is a deconvolution problem,
which demands long-distance information that is difficult to capture by CNNs
with small convolution kernels. The multi-layer perceptron (MLP) can model such
long-distance information, but it requires a fixed input size. In this paper,
we proposed Recon3DMLP, a hybrid of CNN modules with small kernels for
low-frequency reconstruction and adaptive MLP (dMLP) modules with large kernels
to boost the high-frequency reconstruction, for 3D MRI reconstruction. We
further utilized the circular shift operation based on MRI physics such that
dMLP accepts arbitrary image size and can extract global information from the
entire FOV. We also propose a GPU memory efficient data fidelity module that
can reduce $>$50$\%$ memory. We compared Recon3DMLP with other CNN-based models
on a high-resolution (HR) 3D MRI dataset. Recon3DMLP improves HR 3D
reconstruction and outperforms several existing CNN-based models under similar
GPU memory consumption, which demonstrates that Recon3DMLP is a practical
solution for HR 3D MRI reconstruction.
- Abstract(参考訳): 2次元MRIと比較して、3次元MRIは空間分解能と信号-雑音比が優れている。
しかし,3次元MRI画像の再構成は困難である。
現在の手法は主に、小さなカーネルを持つ畳み込みニューラルネットワーク(CNN)に基づいており、大きな画像サイズとGPUメモリの制約のため、3D MRI再構成に十分な適合能力を持つにはスケールアップが困難である。
さらに、MRI再構成は非畳み込み問題であり、小さな畳み込みカーネルを持つCNNが捉えにくい長距離情報を必要とする。
多層パーセプトロン(MLP)はそのような長距離情報をモデル化することができるが、一定の入力サイズを必要とする。
本稿では,低周波再構成用CNNモジュールと低周波再構成用DMLPモジュールを併用したRecon3DMLPを提案する。
さらに,dMLPが任意の画像サイズを受け入れ,FOV全体からグローバル情報を抽出できるように,MRI物理に基づく円形シフト操作を利用した。
また、gpuメモリ効率の良いデータフィデリティモジュールを提案し、$>$50$\%$メモリを削減できる。
我々はRecon3DMLPを高分解能(HR)3次元MRIデータセット上で他のCNNモデルと比較した。
Recon3DMLPはHR 3Dの再構成を改善し、同様のGPUメモリ消費下で既存のCNNベースのモデルより優れており、Recon3DMLPがHR 3D MRI再構成の実用的なソリューションであることを示している。
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