論文の概要: Detecting Histologic & Clinical Glioblastoma Patterns of Prognostic
Relevance
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2302.00669v2
- Date: Mon, 15 May 2023 17:07:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-16 23:26:17.208068
- Title: Detecting Histologic & Clinical Glioblastoma Patterns of Prognostic
Relevance
- Title(参考訳): 予後関連因子の組織学的および臨床組織型Glioblastomaパターンの検出
- Authors: Bhakti Baheti, Sunny Rai, Shubham Innani, Garv Mehdiratta, Sharath
Chandra Guntuku, MacLean P. Nasrallah, Spyridon Bakas
- Abstract要約: グリオ芽腫は中枢神経系で最も一般的で攻撃的な悪性成人腫瘍である。
18年前に現在の標準治療を採用して以降,実質的な予後改善は認められていない。
ここでは,H&E染色WSIとOSに関する臨床データから,予後関連特性の同定に焦点をあてる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.281092892485014
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Glioblastoma is the most common and aggressive malignant adult tumor of the
central nervous system, with a grim prognosis and heterogeneous morphologic and
molecular profiles. Since adopting the current standard-of-care treatment 18
years ago, no substantial prognostic improvement has been noticed. Accurate
prediction of patient overall survival (OS) from histopathology whole slide
images (WSI) integrated with clinical data using advanced computational methods
could optimize clinical decision-making and patient management. Here, we focus
on identifying prognostically relevant glioblastoma characteristics from H&E
stained WSI & clinical data relating to OS. The exact approach for WSI
capitalizes on the comprehensive curation of apparent artifactual content and
an interpretability mechanism via a weakly supervised attention-based
multiple-instance learning algorithm that further utilizes clustering to
constrain the search space. The automatically placed patterns of high
diagnostic value classify each WSI as representative of short or
long-survivors. Further assessment of the prognostic relevance of the
associated clinical patient data is performed both in isolation and in an
integrated manner, using XGBoost and SHapley Additive exPlanations (SHAP).
Identifying tumor morphological & clinical patterns associated with short and
long OS will enable the clinical neuropathologist to provide additional
relevant prognostic information to the treating team and suggest avenues of
biological investigation for understanding and potentially treating
glioblastoma.
- Abstract(参考訳): グリオブラスト腫は中枢神経系で最も一般的で攻撃的な悪性成人腫瘍であり、グリム予後と異種形態および分子プロファイルがある。
18年前に現在の標準治療を採用して以降,実質的な予後改善は認められていない。
臨床データと統合された病理組織像から患者の総合生存率(OS)の正確な予測は,臨床意思決定と患者管理を最適化することができる。
ここでは,H&E染色WSIおよびOSに関する臨床データから,予後に関連のあるグリオ芽腫の特徴を同定することに焦点を当てた。
WSIの正確なアプローチは、クラスタリングを利用して検索空間を制約する弱い注意に基づくマルチインスタンス学習アルゴリズムを通じて、明らかなアーティファクトコンテンツの包括的キュレーションと解釈可能性メカニズムを活かしている。
高診断値の自動配置パターンは、各wsiを短命または長生きの代表として分類する。
xgboost と shapley additive explanations (shap) を用いて、関連する臨床患者データの予後のさらなる妥当性を単独および統合的に評価する。
短いosと長いosに関連する腫瘍の形態と臨床パターンを特定することで、臨床神経病理学者は治療チームにさらなる関連する予後情報を提供し、グリオブラスト腫の理解と治療のための生物学的研究の道筋を示唆することができる。
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