論文の概要: Efficient Classification of SARS-CoV-2 Spike Sequences Using Federated
Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2302.08688v2
- Date: Wed, 8 Nov 2023 22:26:28 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-10 18:50:29.165836
- Title: Efficient Classification of SARS-CoV-2 Spike Sequences Using Federated
Learning
- Title(参考訳): フェデレートラーニングを用いたSARS-CoV-2スパイクシーケンスの効率的な分類
- Authors: Prakash Chourasia, Taslim Murad, Zahra Tayebi, Sarwan Ali, Imdad Ullah
Khan and Murray Patterson
- Abstract要約: データ共有なしでSARS-CoV-2スパイクシーケンスを分散解析する。
我々は、新型コロナウイルスの変種識別タスクにおいて、全体的な精度を93%の精度で達成した。
我々は、この概念実証を利用して、プライバシ保護パンデミック対応戦略を実装する予定です。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.497217246897902
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: This paper presents a federated learning (FL) approach to train an AI model
for SARS-Cov-2 variant classification. We analyze the SARS-CoV-2 spike
sequences in a distributed way, without data sharing, to detect different
variants of this rapidly mutating coronavirus. Our method maintains the
confidentiality of local data (that could be stored in different locations) yet
allows us to reliably detect and identify different known and unknown variants
of the novel coronavirus SARS-CoV-2. Using the proposed approach, we achieve an
overall accuracy of $93\%$ on the coronavirus variant identification task. We
also provide details regarding how the proposed model follows the main laws of
federated learning, such as Laws of data ownership, data privacy, model
aggregation, and model heterogeneity. Since the proposed model is distributed,
it could scale on ``Big Data'' easily. We plan to use this proof-of-concept to
implement a privacy-preserving pandemic response strategy.
- Abstract(参考訳): 本稿では,SARS-Cov-2変種分類のためのAIモデルを訓練するためのFLアプローチを提案する。
我々は,SARS-CoV-2のスパイク配列をデータ共有なしで分散解析し,この急速変異型ウイルスの異なる変種を検出する。
本手法は, 地域データの機密性(異なる場所に保存できる)を維持しながら, 新型コロナウイルスSARS-CoV-2の様々な変種を確実に検出し, 同定することができる。
提案手法を用いて, 新型コロナウイルスの変種識別タスクにおいて, 総合的精度93%の精度を達成する。
また,提案モデルが,データ所有の法則,データプライバシ,モデル集約,モデル不均質性といった,連合学習の主な法則にどのように従っているかの詳細を述べる。
提案したモデルが分散されているため、 ``Big Data'' に簡単にスケールできる。
我々はこの概念実証を,プライバシ保護型パンデミック対応戦略の実施に活用する予定である。
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