論文の概要: Time Associated Meta Learning for Clinical Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.02570v1
- Date: Sun, 5 Mar 2023 03:54:54 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-07 18:51:54.827196
- Title: Time Associated Meta Learning for Clinical Prediction
- Title(参考訳): 臨床予測のための時間関連メタラーニング
- Authors: Hao Liu, Muhan Zhang, Zehao Dong, Lecheng Kong, Yixin Chen, Bradley
Fritz, Dacheng Tao, Christopher King
- Abstract要約: 本稿では,時間関連メタラーニング(TAML)手法を提案する。
タスク分割後のスパーシリティ問題に対処するため、TAMLは時間情報共有戦略を採用し、正のサンプル数を増やす。
複数の臨床データセットに対するTAMLの有効性を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 78.99422473394029
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Rich Electronic Health Records (EHR), have created opportunities to improve
clinical processes using machine learning methods. Prediction of the same
patient events at different time horizons can have very different applications
and interpretations; however, limited number of events in each potential time
window hurts the effectiveness of conventional machine learning algorithms. We
propose a novel time associated meta learning (TAML) method to make effective
predictions at multiple future time points. We view time-associated disease
prediction as classification tasks at multiple time points. Such
closely-related classification tasks are an excellent candidate for model-based
meta learning. To address the sparsity problem after task splitting, TAML
employs a temporal information sharing strategy to augment the number of
positive samples and include the prediction of related phenotypes or events in
the meta-training phase. We demonstrate the effectiveness of TAML on multiple
clinical datasets, where it consistently outperforms a range of strong
baselines. We also develop a MetaEHR package for implementing both
time-associated and time-independent few-shot prediction on EHR data.
- Abstract(参考訳): Rich Electronic Health Records (EHR)は、機械学習を用いて臨床プロセスを改善する機会を生み出している。
異なる時間軸での同じ患者事象の予測は、全く異なる応用と解釈を持つ可能性があるが、潜在的な時間ウィンドウ内の限られたイベント数では、従来の機械学習アルゴリズムの有効性が損なわれる。
本稿では,複数の時点において効果的な予測を行うための新しい時間関連メタ学習(taml)手法を提案する。
我々は、時間関連疾患予測を、複数の時点における分類課題と見なしている。
このような密接に関連する分類タスクは、モデルに基づくメタ学習の優れた候補である。
タスク分割後の空間的問題に対処するため、TAMLは、時間的情報共有戦略を用いて、陽性サンプルの数を増やし、メタトレーニングフェーズにおける関連する表現型やイベントの予測を含む。
そこで本研究では,複数の臨床データセットにおけるtamlの有効性を実証する。
また、EHRデータに時間関連および時間非依存の少ショット予測を実装するためのMetaEHRパッケージも開発した。
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