論文の概要: Optimizing Convolutional Neural Networks for Chronic Obstructive
Pulmonary Disease Detection in Clinical Computed Tomography Imaging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.07189v1
- Date: Mon, 13 Mar 2023 15:30:28 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-14 14:13:42.335888
- Title: Optimizing Convolutional Neural Networks for Chronic Obstructive
Pulmonary Disease Detection in Clinical Computed Tomography Imaging
- Title(参考訳): 臨床CTにおける慢性閉塞性肺疾患検出のための畳み込みニューラルネットワークの最適化
- Authors: Tina Dorosti (1-3), Manuel Schultheiss (1-3), Felix Hofmann (3), Luisa
Kirchner (3), Theresa Urban (1-3), Franz Pfeiffer (1-4), Johannes Thalhammer
(1-3), Florian Schaff (1 and 2), Tobias Lasser (2 and 5), and Daniela
Pfeiffer (1-4) ((1) Chair of Biomedical Physics, Department of Physics,
School of Natural Sciences, Technical University of Munich, Germany, (2)
Munich Institute of Biomedical Engineering, Technical University of Munich,
Germany, (3) Department of Diagnostic and Interventional Radiology, School of
Medicine, Klinikum rechts der Isar, Technical University of Munich, Germany,
(4) Institute for Advanced Study, Technical University of Munich, Germany,
(5) Computational Imaging and Inverse Problems, Department of Informatics,
School of Computation, Information, and Technology, Technical University of
Munich, Germany)
- Abstract要約: 慢性閉塞性肺疾患(COPD)は世界中で死因となっている。
胸部X線CT検査は肺の形態変化の指標となる。
深層学習モデルを用いて, COPDの自動検出が可能であることが示されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) is a leading cause of death
worldwide, yet early detection and treatment can prevent the progression of the
disease. In contrast to the conventional method of detecting COPD with
spirometry tests, X-ray Computed Tomography (CT) scans of the chest provide a
measure of morphological changes in the lung. It has been shown that automated
detection of COPD can be performed with deep learning models. However, the
potential of incorporating optimal window setting selection, typically carried
out by clinicians during examination of CT scans for COPD, is generally
overlooked in deep learning approaches. We aim to optimize the binary
classification of COPD with densely connected convolutional neural networks
(DenseNets) through implementation of manual and automated Window-Setting
Optimization (WSO) steps. Our dataset consisted of 78 CT scans from the
Klinikum rechts der Isar research hospital. Repeated inference on the test set
showed that without WSO, the plain DenseNet resulted in a mean slice-level AUC
of 0.80$\pm$0.05. With input images manually adjusted to the emphysema window
setting, the plain DenseNet model predicted COPD with a mean AUC of
0.86$\pm$0.04. By automating the WSO through addition of a customized layer to
the DenseNet, an optimal window setting in the proximity of the emphysema
window setting was learned and a mean AUC of 0.82$\pm$0.04 was achieved.
Detection of COPD with DenseNet models was optimized by WSO of CT data to the
emphysema window setting range, demonstrating the importance of implementing
optimal window setting selection in the deep learning pipeline.
- Abstract(参考訳): 慢性閉塞性肺疾患(copd)は世界中で主要な死因であるが、早期発見と治療は肺疾患の進行を予防することができる。
胸部CT(X線CT)による肺形態変化の計測は,従来の呼吸機能検査法とは対照的に,胸部CT検査は肺形態変化の指標となる。
深層学習モデルを用いて, COPDの自動検出が可能であることが示されている。
しかし, COPD のCT スキャン検査において臨床医が行う最適なウィンドウ設定選択を組み込むことの可能性は, 一般的には深層学習のアプローチでは見過ごされがちである。
我々は、手動および自動ウィンドウセッティング最適化(WSO)ステップの実装により、密結合畳み込みニューラルネットワーク(DenseNets)によるPDのバイナリ分類を最適化することを目指している。
我々のデータセットは、klinikum rechts der isar research hospitalの78のctスキャンで構成されていた。
テストセットで繰り返し推測した結果、WSOがなければ、普通のDenseNetの平均スライスレベルAUCは0.80$\pm$0.05となった。
入力画像は気腫ウィンドウ設定に手動で調整され、普通のDenseNetモデルは平均AUCが0.86$\pm$0.04と予測した。
DenseNetにカスタマイズされたレイヤを追加してWSOを自動化することにより、気腫窓設定に近い最適なウィンドウ設定が学習され、平均AUCは0.82$\pm$0.04となった。
DenseNet モデルによる COPD の検出は,CT データの WSO から気腫窓設定範囲に最適化され,深層学習パイプラインにおいて最適なウィンドウ設定を選択することの重要性が示された。
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