論文の概要: Optimizing Convolutional Neural Networks for Chronic Obstructive
Pulmonary Disease Detection in Clinical Computed Tomography Imaging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.07189v2
- Date: Fri, 28 Jul 2023 11:49:02 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-31 16:12:42.930019
- Title: Optimizing Convolutional Neural Networks for Chronic Obstructive
Pulmonary Disease Detection in Clinical Computed Tomography Imaging
- Title(参考訳): 臨床CTにおける慢性閉塞性肺疾患検出のための畳み込みニューラルネットワークの最適化
- Authors: Tina Dorosti, Manuel Schultheiss, Felix Hofmann, Johannes Thalhammer,
Luisa Kirchner, Theresa Urban, Franz Pfeiffer, Florian Schaff, Tobias Lasser,
Daniela Pfeiffer
- Abstract要約: 本研究は,CT画像における手動調整と自動ウィンドウ設定最適化(WSO)について検討した。
DenseNetは最も効率的なバックボーンであり、WSOのない平均AUCは0.80[0.76, 0.85]に達した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.6152925083426117
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Purpose: To optimize the binary detection of Chronic Obstructive Pulmonary
Disease (COPD) based on emphysema presence in the lung with convolutional
neural networks (CNN) by exploring manually adjusted versus automated
window-setting optimization (WSO) on computed tomography (CT) images.
Methods: 7,194 CT images (3,597 with COPD; 3,597 healthy controls) from 78
subjects (43 with COPD; 35 healthy controls) were selected retrospectively
(10.2018-12.2019) and preprocessed. For each image, intensity values were
manually clipped to the emphysema window setting and a baseline 'full-range'
window setting. Class-balanced train, validation, and test sets contained
3,392, 1,114, and 2,688 images. The network backbone was optimized by comparing
various CNN architectures. Furthermore, automated WSO was implemented by adding
a customized layer to the model. The image-level area under the Receiver
Operating Characteristics curve (AUC) [lower, upper limit 95% confidence] and
P-values calculated from one-sided Mann-Whitney U-test were utilized to compare
model variations.
Results: Repeated inference (n=7) on the test set showed that the DenseNet
was the most efficient backbone and achieved a mean AUC of 0.80 [0.76, 0.85]
without WSO. Comparably, with input images manually adjusted to the emphysema
window, the DenseNet model predicted COPD with a mean AUC of 0.86 [0.82, 0.89]
(P=0.03). By adding a customized WSO layer to the DenseNet, an optimal window
in the proximity of the emphysema window setting was learned automatically, and
a mean AUC of 0.82 [0.78, 0.86] was achieved.
Conclusion: Detection of COPD with DenseNet models was improved by WSO of CT
data to the emphysema window setting range.
- Abstract(参考訳): 目的:ct画像上の手動調整型自動ウィンドウセット最適化(wso)を探索し,肺気腫と畳み込みニューラルネットワーク(cnn)を用いた慢性閉塞性肺疾患(copd)の2値検出を最適化すること。
方法は7,194枚のCT画像(3,597枚,3,597枚),78名の被験者(43枚,35枚)を振り返り(10.2018-12.2019)、前処理した。
各画像に対して、強度値を手動で気腫窓設定と「フルレンジ」窓設定にクリップした。
テストセットは3,392枚、1,114枚、2,688枚であった。
ネットワークバックボーンは、様々なCNNアーキテクチャを比較することで最適化された。
さらに、モデルにカスタマイズされたレイヤを追加することで、WSOの自動化が実現されました。
片側Mann-Whitney U-testから算出した画像レベル領域(AUC)[下限95%信頼度]とP値(P値)をモデル変動の比較に利用した。
結果: テストセットの繰り返し推論 (n=7) では, DenseNet が最も効率的なバックボーンであり, WSO を使わずに平均 AUC が 0.80 [0.76, 0.85] に達した。
入力画像が気腫ウィンドウに手動で調整された場合、DenseNetモデルは平均AUCが0.86[0.82, 0.89](P=0.03)であると予測した。
濃密網にカスタマイズされたwso層を加えることで、気腫窓設定近傍の最適な窓を自動的に学習し、平均aucを0.82[0.78, 0.86]とした。
結語: DenseNet モデルを用いた COPD の検出は,CT データから気腫窓設定範囲まで改善された。
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論文 参考訳(メタデータ) (2020-02-03T15:47:00Z)
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