論文の概要: A comparative evaluation of image-to-image translation methods for stain
transfer in histopathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.17009v1
- Date: Wed, 29 Mar 2023 20:27:49 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-31 15:13:54.980043
- Title: A comparative evaluation of image-to-image translation methods for stain
transfer in histopathology
- Title(参考訳): 病理組織学における画像から画像への変換法の比較評価
- Authors: Igor Zingman, Sergio Frayle, Ivan Tankoyeu, Segrey Sukhanov, Fabian
Heinemann
- Abstract要約: 画像から画像への変換(I2I)法では、オリジナル画像の内容を共有するが、異なるスタイルの人工画像を生成することができる。
I2I法は、異なるタイプの染色からシリカ染色組織の人工像を生成するためにも用いられた。
GANに基づく画像処理法では,12の染色転移法を比較し,その内3つの手法が従来手法と9つの手法に基づいている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Image-to-image translation (I2I) methods allow the generation of artificial
images that share the content of the original image but have a different style.
With the advances in Generative Adversarial Networks (GANs)-based methods, I2I
methods enabled the generation of artificial images that are indistinguishable
from natural images. Recently, I2I methods were also employed in histopathology
for generating artificial images of in silico stained tissues from a different
type of staining. We refer to this process as stain transfer. The number of I2I
variants is constantly increasing, which makes a well justified choice of the
most suitable I2I methods for stain transfer challenging. In our work, we
compare twelve stain transfer approaches, three of which are based on
traditional and nine on GAN-based image processing methods. The analysis relies
on complementary quantitative measures for the quality of image translation,
the assessment of the suitability for deep learning-based tissue grading, and
the visual evaluation by pathologists. Our study highlights the strengths and
weaknesses of the stain transfer approaches, thereby allowing a rational choice
of the underlying I2I algorithms. Code, data, and trained models for stain
transfer between H&E and Masson's Trichrome staining will be made available
online.
- Abstract(参考訳): image-to-image translation (i2i) メソッドは、オリジナル画像の内容を共有するが異なるスタイルを持つ人工画像を生成することができる。
GAN(Generative Adversarial Networks)ベースの手法の進歩により、I2I法は自然画像と区別できない人工画像の生成を可能にした。
病理組織学においてもi2i法が用いられており,in silico染色組織から異なる染色形態の人工画像を生成する。
この過程を染色転移と呼ぶ。
I2Iの変種数は常に増加しており、染色輸送に最も適したI2I法を適切に選択することが困難である。
本研究では,従来の3つのステンドトランスファー法と,ganベースの画像処理法を併用した9つのステンドトランスファー法を比較した。
この分析は、画像翻訳の品質、深層学習に基づく組織評価の適性の評価、および病理医による視覚的評価の相補的な定量的尺度に依存する。
本研究は,汚れ移動アプローチの強みと弱みを強調し,基礎となるi2iアルゴリズムの合理的な選択を可能にした。
H&EとMassonのTrichrome染色の間の染色のコード、データ、訓練されたモデルがオンラインで提供される。
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