論文の概要: A Multi-Institutional Open-Source Benchmark Dataset for Breast Cancer
Clinical Decision Support using Synthetic Correlated Diffusion Imaging Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2304.05623v1
- Date: Wed, 12 Apr 2023 05:41:44 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-04-13 16:08:47.704491
- Title: A Multi-Institutional Open-Source Benchmark Dataset for Breast Cancer
Clinical Decision Support using Synthetic Correlated Diffusion Imaging Data
- Title(参考訳): 合成関連拡散画像データを用いた乳がん臨床診断支援のための複数施設のオープンソースベンチマークデータセット
- Authors: Chi-en Amy Tai, Hayden Gunraj, Alexander Wong
- Abstract要約: Cancer-Net BCaは、乳がん患者の画像データであるボリュームCDI$s$の複数機関のオープンソースベンチマークデータセットである。
Cancer-Net BCaは、機械学習の進歩を加速し、がんと戦う臨床医を助ける、グローバルなオープンソースイニシアチブの一部として、一般公開されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 82.74877848011798
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Recently, a new form of magnetic resonance imaging (MRI) called synthetic
correlated diffusion (CDI$^s$) imaging was introduced and showed considerable
promise for clinical decision support for cancers such as prostate cancer when
compared to current gold-standard MRI techniques. However, the efficacy for
CDI$^s$ for other forms of cancers such as breast cancer has not been as
well-explored nor have CDI$^s$ data been previously made publicly available.
Motivated to advance efforts in the development of computer-aided clinical
decision support for breast cancer using CDI$^s$, we introduce Cancer-Net BCa,
a multi-institutional open-source benchmark dataset of volumetric CDI$^s$
imaging data of breast cancer patients. Cancer-Net BCa contains CDI$^s$
volumetric images from a pre-treatment cohort of 253 patients across ten
institutions, along with detailed annotation metadata (the lesion type, genetic
subtype, longest diameter on the MRI (MRLD), the Scarff-Bloom-Richardson (SBR)
grade, and the post-treatment breast cancer pathologic complete response (pCR)
to neoadjuvant chemotherapy). We further examine the demographic and tumour
diversity of the Cancer-Net BCa dataset to gain deeper insights into potential
biases. Cancer-Net BCa is publicly available as a part of a global open-source
initiative dedicated to accelerating advancement in machine learning to aid
clinicians in the fight against cancer.
- Abstract(参考訳): 近年, 合成相関拡散(CDI$^s$)画像と呼ばれる新しいMRI法が導入され, 現行の金標準MRI法と比較して, 前立腺癌などのがんに対する臨床診断支援にかなりの期待が持たれている。
しかし、乳がんなどの他の種類のがんに対するcdi$^s$の有効性は十分に検討されておらず、cdi$^s$のデータも以前公開されていた。
CDI$^s$を用いて、乳がんに対するコンピュータ支援臨床診断支援の開発を推進すべく、乳がん患者の画像データであるCDI$^s$の多施設向けオープンソースベンチマークデータセットであるC cancer-Net BCaを紹介した。
癌-Net BCaは10施設にわたる253人の前治療コホートからCDI$^s$の容積画像と、詳細な診断メタデータ(病変型、遺伝子亜型、MRI(MRLD)の最長径、SBR(Scarff-Bloom-Richardson)グレード、治療後の乳癌の病理学的完全反応(pCR)などを含む。
我々はさらに、がん-net bcaデータセットの人口動態と腫瘍多様性を調べ、潜在的なバイアスに対する深い洞察を得る。
Cancer-Net BCaは、機械学習の進歩を加速し、がんと戦う臨床医を助ける、グローバルなオープンソースイニシアチブの一部として、一般公開されている。
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