論文の概要: Towards Tumour Graph Learning for Survival Prediction in Head & Neck
Cancer Patients
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2304.08106v1
- Date: Mon, 17 Apr 2023 09:32:06 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-04-18 15:55:47.547585
- Title: Towards Tumour Graph Learning for Survival Prediction in Head & Neck
Cancer Patients
- Title(参考訳): 頭頸部癌における生存予測のためのTumour Graph Learning
- Authors: Angel Victor Juanco Muller, Joao F. C. Mota, Keith A. Goatman and
Corne Hoogendoorn
- Abstract要約: 2020年に世界で100万人近い頭頸部がんが診断された。
自動セグメンテーションと予後推定アプローチは、各患者が最も効果的な治療を受けるのに役立つ。
本稿では、任意の視野(FoV)PETとCT登録スキャンでこれらの機能を実行するためのフレームワークを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: With nearly one million new cases diagnosed worldwide in 2020, head \& neck
cancer is a deadly and common malignity. There are challenges to decision
making and treatment of such cancer, due to lesions in multiple locations and
outcome variability between patients. Therefore, automated segmentation and
prognosis estimation approaches can help ensure each patient gets the most
effective treatment. This paper presents a framework to perform these functions
on arbitrary field of view (FoV) PET and CT registered scans, thus approaching
tasks 1 and 2 of the HECKTOR 2022 challenge as team \texttt{VokCow}. The method
consists of three stages: localization, segmentation and survival prediction.
First, the scans with arbitrary FoV are cropped to the head and neck region and
a u-shaped convolutional neural network (CNN) is trained to segment the region
of interest. Then, using the obtained regions, another CNN is combined with a
support vector machine classifier to obtain the semantic segmentation of the
tumours, which results in an aggregated Dice score of 0.57 in task 1. Finally,
survival prediction is approached with an ensemble of Weibull accelerated
failure times model and deep learning methods. In addition to patient health
record data, we explore whether processing graphs of image patches centred at
the tumours via graph convolutions can improve the prognostic predictions. A
concordance index of 0.64 was achieved in the test set, ranking 6th in the
challenge leaderboard for this task.
- Abstract(参考訳): 2020年に世界で100万人近い新規患者が診断され、頭頸部がんは致命的かつ一般的な悪性腫瘍である。
複数の部位の病変と患者間の予後の変動により、そのようながんの意思決定と治療は困難である。
したがって、自動セグメンテーションと予後推定アプローチは、各患者が最も効果的な治療を受けるのに役立つ。
本稿では、任意の視野(FoV)PETおよびCT登録スキャン上でこれらの機能を実行するためのフレームワークを提案し、チーム \texttt{VokCow} としてHECKTOR 2022チャレンジのタスク1と2に接近する。
本手法は, 局所化, セグメンテーション, 生存予測の3段階からなる。
まず、任意のFoVのスキャンを頭頸部領域にトリミングし、U字型畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を訓練して、興味のある領域を分割する。
そして、得られた領域を用いて、別のCNNを支持ベクトル機械分類器と組み合わせて腫瘍の意味的セグメンテーションを求め、タスク1におけるDiceスコアが0.57となる。
最後に、weibullaccelerated failure time modelとdeep learning methodのアンサンブルを用いてサバイバル予測にアプローチする。
患者の健康記録データに加えて,グラフ畳み込みによる腫瘍中心の画像パッチの処理グラフが予後予測を改善できるかどうかについて検討する。
テストセットでは0.64の一致指数が達成され、このタスクのチャレンジリーダーボードでは6位となった。
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