論文の概要: Segmentation and Vascular Vectorization for Coronary Artery by
Geometry-based Cascaded Neural Network
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.04208v1
- Date: Sun, 7 May 2023 07:26:41 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-09 17:02:38.997113
- Title: Segmentation and Vascular Vectorization for Coronary Artery by
Geometry-based Cascaded Neural Network
- Title(参考訳): Geometry-based Cascaded Neural Network による冠動脈の分節と血管ベクトル化
- Authors: Xiaoyu Yang, Lijian Xu, Simon Yu, Qing Xia, Hongsheng Li, Shaoting
Zhang
- Abstract要約: そこで本研究では,冠動脈の形状をベースとしたカスケード分割法を提案する。
冠動脈のメッシュは連続的かつ正確であり, ねじれ, 洗練された冠状動脈構造を有する。
本手法は, 分節血管の断片化を伴わない, 正確で無傷でスムーズな冠動脈を作製する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 26.88627331841325
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Segmentation of the coronary artery is an important task for the quantitative
analysis of coronary computed tomography angiography (CCTA) images and is being
stimulated by the field of deep learning. However, the complex structures with
tiny and narrow branches of the coronary artery bring it a great challenge.
Coupled with the medical image limitations of low resolution and poor contrast,
fragmentations of segmented vessels frequently occur in the prediction.
Therefore, a geometry-based cascaded segmentation method is proposed for the
coronary artery, which has the following innovations: 1) Integrating geometric
deformation networks, we design a cascaded network for segmenting the coronary
artery and vectorizing results. The generated meshes of the coronary artery are
continuous and accurate for twisted and sophisticated coronary artery
structures, without fragmentations. 2) Different from mesh annotations
generated by the traditional marching cube method from voxel-based labels, a
finer vectorized mesh of the coronary artery is reconstructed with the
regularized morphology. The novel mesh annotation benefits the geometry-based
segmentation network, avoiding bifurcation adhesion and point cloud dispersion
in intricate branches. 3) A dataset named CCA-200 is collected, consisting of
200 CCTA images with coronary artery disease. The ground truths of 200 cases
are coronary internal diameter annotations by professional radiologists.
Extensive experiments verify our method on our collected dataset CCA-200 and
public ASOCA dataset, with a Dice of 0.778 on CCA-200 and 0.895 on ASOCA,
showing superior results. Especially, our geometry-based model generates an
accurate, intact and smooth coronary artery, devoid of any fragmentations of
segmented vessels.
- Abstract(参考訳): 冠動脈の分節化は、冠動脈ct血管造影(ccta)画像の定量的解析に重要な課題であり、深層学習の分野によって刺激されている。
しかし、冠状動脈の枝が小さくて狭い複雑な構造は大きな課題となる。
低解像度と低コントラストの医療画像制限と組み合わせて、分割された血管の断片化が予測に頻繁に発生する。
そこで, 冠状動脈に対して幾何学に基づくカスケード・セグメンテーション法が提案されている。
1) 形状変形ネットワークを統合し, 冠動脈の分節化とベクトル化を行うカスケードネットワークを設計する。
冠動脈のメッシュは、断片化することなく、ねじれ、洗練された冠動脈構造に対して連続的かつ正確である。
2)voxelラベルを用いた従来のマーチングキューブ法によるメッシュアノテーションとは異なり,冠状動脈の微細なベクトル化メッシュを正規化した形態で再構成する。
メッシュアノテーションは幾何学に基づくセグメンテーションネットワークの恩恵を受け、複雑な枝の分岐と点雲の分散を避ける。
3)冠状動脈疾患を伴う200ccta画像からなるcca-200というデータセットが収集される。
200例の根底真理は、専門放射線科医による冠動脈内径アノテーションである。
CCA-200とパブリックASOCAデータセットでは,CCA-200では0.778,ASOCAでは0.895であり,より優れた結果が得られた。
特に、我々の幾何学的モデルでは、分割された血管の断片化を伴わない正確で無傷で滑らかな冠動脈を生成する。
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