論文の概要: Text2Cohort: Facilitating Intuitive Access to Biomedical Data with
Natural Language Cohort Discovery
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.07637v3
- Date: Sat, 25 Nov 2023 17:19:36 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-30 16:18:52.138463
- Title: Text2Cohort: Facilitating Intuitive Access to Biomedical Data with
Natural Language Cohort Discovery
- Title（参考訳）: text2cohort:自然言語コホート発見による生体医学データへの直感的アクセスの促進
- Authors: Pranav Kulkarni, Adway Kanhere, Paul H. Yi, Vishwa S. Parekh
- Abstract要約: 大規模言語モデル(LLM)は、自然言語処理タスクに非常に便利なことを証明している。
画像データコモンズ(IDC)におけるユーザフレンドリーな自然言語コホート発見を容易にするLLMベースのツールキットであるText2Cohortを開発した。
提案手法は,ユーザ入力をグラウンド手法を用いてIDCクエリに変換し,クエリの応答を返却する。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 4.468858802955592
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The Imaging Data Commons (IDC) is a cloud-based database that provides
researchers with open access to cancer imaging data, with the goal of
facilitating collaboration. However, cohort discovery within the IDC database
has a significant technical learning curve. Recently, large language models
(LLM) have demonstrated exceptional utility for natural language processing
tasks. We developed Text2Cohort, a LLM-powered toolkit to facilitate
user-friendly natural language cohort discovery in the IDC. Our method
translates user input into IDC queries using grounding techniques and returns
the query's response. We evaluate Text2Cohort on 50 natural language inputs,
from information extraction to cohort discovery. Our toolkit successfully
generated responses with an 88% accuracy and 0.94 F1 score. We demonstrate that
Text2Cohort can enable researchers to discover and curate cohorts on IDC with
high levels of accuracy using natural language in a more intuitive and
user-friendly way.
- Abstract（参考訳）: imaging data commons(idc)はクラウドベースのデータベースで、研究者にがん画像データへのオープンアクセスを提供し、コラボレーションを促進することを目的としている。
しかし、IDCデータベース内のコホート発見は、重要な技術学習曲線を持っている。
近年、大規模言語モデル(llm)は自然言語処理タスクに例外的な有用性を示している。
我々は,idcにおけるユーザフレンドリーな自然言語コホート発見を容易にする,llmを活用したツールキットtext2cohortを開発した。
提案手法は,ユーザ入力をグラウンド手法を用いてIDCクエリに変換し,クエリの応答を返す。
情報抽出からコホート発見まで,50の自然言語入力に対するtext2cohortの評価を行った。
ツールキットは88%の精度と0.94のF1スコアで応答を生成できた。
text2cohortは、研究者がより直感的でユーザーフレンドリーな方法で自然言語を使用して、idc上のコホートを高い精度で発見し、キュレートすることができることを実証する。
関連論文リスト
- GigaCheck: Detecting LLM-generated Content [72.27323884094953]
本稿では,GigaCheckを提案することによって生成したテキスト検出の課題について検討する。
本研究は,LLM生成テキストとLLM生成テキストを区別する手法と,Human-Machine協調テキストにおけるLLM生成間隔を検出する手法について検討する。
具体的には,テキスト内のAI生成間隔をローカライズするために,コンピュータビジョンから適応したDETRのような検出モデルと組み合わせて,微調整の汎用LLMを用いる。
論文 参考訳（メタデータ） (2024-10-31T08:30:55Z) - DiscoveryBench: Towards Data-Driven Discovery with Large Language Models [50.36636396660163]
我々は、データ駆動探索の多段階プロセスを形式化する最初の包括的なベンチマークであるDiscoveryBenchを紹介する。
我々のベンチマークには、社会学や工学などの6つの分野にまたがる264のタスクが含まれている。
私たちのベンチマークでは、自律的なデータ駆動型発見の課題を説明し、コミュニティが前進するための貴重なリソースとして役立ちます。
論文 参考訳（メタデータ） (2024-07-01T18:58:22Z) - Enhancing Knowledge Retrieval with In-Context Learning and Semantic Search through Generative AI [3.9773527114058855]
本稿では,大規模言語モデルの生成能力とベクトルデータベースの高速かつ正確な検索能力を組み合わせた新しい手法を提案する。
開発したGTR(Generative Text Retrieval)は,非構造化データと構造化データの両方に適用可能である。
改良されたモデルであるGenerative Tabular Text Retrieval (GTR-T) は、大規模データベースクエリの効率を実証した。
論文 参考訳（メタデータ） (2024-06-13T23:08:06Z) - Toward a Team of AI-made Scientists for Scientific Discovery from Gene
Expression Data [9.767546641019862]
我々は、科学的な発見パイプラインを合理化するために設計された新しいフレームワーク、AIマニュフェストチーム(TAIS)を紹介する。
TAISは、プロジェクトマネージャ、データエンジニア、ドメインエキスパートを含むシミュレートされた役割で構成され、それぞれがLLM(Large Language Model)によって表現される。
これらの役割は、典型的にはデータ科学者が行うタスクを再現するために協力し、疾患予測遺伝子を特定することに焦点を当てている。
論文 参考訳（メタデータ） (2024-02-15T06:30:12Z) - Ascle: A Python Natural Language Processing Toolkit for Medical Text
Generation [30.883733024137506]
Ascleは医学用テキスト生成のために設計された、先駆的な自然言語処理(NLP)ツールキットである。
Ascleは、簡単に使えるオールインワンソリューションを備えたバイオメディカル研究者や医療専門家向けにカスタマイズされている。
論文 参考訳（メタデータ） (2023-11-28T08:13:29Z) - Knowledge-Infused Prompting: Assessing and Advancing Clinical Text Data
Generation with Large Language Models [48.07083163501746]
臨床自然言語処理には、ドメイン固有の課題に対処できる方法が必要である。
我々は,そのプロセスに知識を注入する,革新的で資源効率のよいアプローチであるClinGenを提案する。
7つのNLPタスクと16のデータセットを比較検討した結果,ClinGenはさまざまなタスクのパフォーマンスを継続的に向上させることがわかった。
論文 参考訳（メタデータ） (2023-11-01T04:37:28Z) - Development and validation of a natural language processing algorithm to
pseudonymize documents in the context of a clinical data warehouse [53.797797404164946]
この研究は、この領域でツールやリソースを共有する際に直面する困難を浮き彫りにしている。
臨床文献のコーパスを12種類に分類した。
私たちは、ディープラーニングモデルと手動ルールの結果をマージして、ハイブリッドシステムを構築します。
論文 参考訳（メタデータ） (2023-03-23T17:17:46Z) - Collecting Interactive Multi-modal Datasets for Grounded Language
Understanding [66.30648042100123]
自然言語タスクを用いた協調型エンボディエージェントの定式化を行った。
広範かつスケーラブルなデータ収集ツールを開発しました。
対話型基底言語理解のための最初のデータセットを収集した。
論文 参考訳（メタデータ） (2022-11-12T02:36:32Z) - Explaining Patterns in Data with Language Models via Interpretable
Autoprompting [143.4162028260874]
本稿では,データを説明する自然言語文字列を生成するアルゴリズムである,解釈可能なオートプロンプト(iPrompt)を提案する。
iPromptは、基盤となるデータセット記述を正確に見つけることで、意味のある洞察を得ることができる。
fMRIデータセットを用いた実験は、iPromptが科学的発見に役立つ可能性を示している。
論文 参考訳（メタデータ） (2022-10-04T18:32:14Z) - Decoding EEG Brain Activity for Multi-Modal Natural Language Processing [9.35961671939495]
自然言語処理タスクを改善するために脳波脳活動データの可能性を体系的に分析する最初の大規模研究を行った。
脳波信号を周波数帯域にフィルタリングすることはブロードバンド信号よりも有益であることがわかった。
単語埋め込みタイプの範囲のために、EEGデータは二分および三分感情の分類を改善し、複数のベースラインを上回ります。
論文 参考訳（メタデータ） (2021-02-17T09:44:21Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト（すべての情報・翻訳含む）の品質を保証せず、本サイト（すべての情報・翻訳含む）を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。