論文の概要: A Novel Dataset Towards Extracting Virus-Host Interactions
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.13317v1
- Date: Thu, 11 May 2023 17:20:49 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-28 05:11:31.747111
- Title: A Novel Dataset Towards Extracting Virus-Host Interactions
- Title(参考訳): ウイルス-宿主相互作用抽出のための新しいデータセット
- Authors: Rasha Alshawi, Atriya Sen, Nathan S. Upham, Beckett Sterner
- Abstract要約: 本稿では、ウイルスと宿主の関連性に関連する命名された分類学および他のエンティティの自動認識のための新しいデータセットについて述べる。
本論文では、このデータセット上で、匿名性認識タスクの事前学習モデルを用いて、いくつかの初期結果について述べる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.0323063834827415
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We describe a novel dataset for the automated recognition of named taxonomic
and other entities relevant to the association of viruses with their hosts. We
further describe some initial results using pre-trained models on the
named-entity recognition (NER) task on this novel dataset. We propose that our
dataset of manually annotated abstracts now offers a Gold Standard Corpus for
training future NER models in the automated extraction of host-pathogen
detection methods from scientific publications, and further explain how our
work makes first steps towards predicting the important human health-related
concept of viral spillover risk automatically from the scientific literature.
- Abstract(参考訳): 本稿では,ウイルスと宿主の関連付けに関連する命名分類学およびその他の実体の自動認識のための新しいデータセットについて述べる。
さらに、この新しいデータセットにおけるNERタスクの事前学習モデルを用いて、いくつかの初期結果について述べる。
筆者らは,手指アノテーション付き抄録のデータセットに,今後のnerモデルのトレーニングのためのゴールド・スタンダード・コーパスが提供され,学術論文からホスト病原体検出手法を自動的に抽出し,本研究がどのようにしてヒトの健康に関連する重要な概念であるウイルス散布リスクを科学文献から自動で予測するための第一歩を踏み出すかを説明する。
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