論文の概要: MicroSegNet: A Deep Learning Approach for Prostate Segmentation on
Micro-Ultrasound Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.19956v2
- Date: Fri, 16 Jun 2023 19:56:42 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-22 01:32:01.972905
- Title: MicroSegNet: A Deep Learning Approach for Prostate Segmentation on
Micro-Ultrasound Images
- Title(参考訳): MicroSegNet: マイクロ超音波画像における前立腺分割の深層学習手法
- Authors: Hongxu Jiang, Muhammad Imran, Preethika Muralidharan, Anjali Patel,
Jake Pensa, Muxuan Liang, Tarik Benidir, Joseph R. Grajo, Jason P. Joseph,
Russell Terry, John Michael DiBianco, Li-Ming Su, Yuyin Zhou, Wayne G.
Brisbane, and Wei Shao
- Abstract要約: マイクロ超音波(micro-US)は、従来の超音波の3.4倍の高分解能を提供する新しい29MHz超音波技術である。
前立腺の分節は、前立腺、膀胱、尿道の間にある人工物と不明瞭な境界のために困難である。
本稿では,これらの課題に対処するために設計されたマルチスケールアノテーション誘導変換器UNetモデルであるMicroSegNetを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.339463639600991
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Micro-ultrasound (micro-US) is a novel 29-MHz ultrasound technique that
provides 3-4 times higher resolution than traditional ultrasound, delivering
comparable accuracy for diagnosing prostate cancer to MRI but at a lower cost.
Accurate prostate segmentation is crucial for prostate volume measurement,
cancer diagnosis, prostate biopsy, and treatment planning. However, prostate
segmentation on microUS is challenging due to artifacts and indistinct borders
between the prostate, bladder, and urethra in the midline. This paper presents
MicroSegNet, a multi-scale annotation-guided transformer UNet model designed
specifically to tackle these challenges. During the training process,
MicroSegNet focuses more on regions that are hard to segment (hard regions),
characterized by discrepancies between expert and non-expert annotations. We
achieve this by proposing an annotation-guided binary cross entropy (AG-BCE)
loss that assigns a larger weight to prediction errors in hard regions and a
lower weight to prediction errors in easy regions. The AG-BCE loss was
seamlessly integrated into the training process through the utilization of
multi-scale deep supervision, enabling MicroSegNet to capture global contextual
dependencies and local information at various scales. We trained our model
using micro-US images from 55 patients, followed by evaluation on 20 patients.
Our MicroSegNet model achieved a Dice coefficient of 0.942 and a Hausdorff
distance of 2.11 mm, outperforming several state-of-the-art segmentation
methods, as well as three human annotators with different experience levels. We
will make our code and dataset publicly available to promote transparency and
collaboration in research.
- Abstract(参考訳): マイクロ超音波(micro-US)は、従来の超音波の3.4倍の高解像度の29MHz超音波技術であり、MRIによる前立腺がんの診断に匹敵する精度を提供するが、低コストである。
正確な前立腺分画は前立腺体積測定、がん診断、前立腺生検、治療計画に不可欠である。
しかし, 前立腺, 膀胱, 尿道間の境界が不明瞭であることから, ミクロスに対する前立腺の分画は困難である。
本稿では,これらの課題に対処するために設計されたマルチスケールアノテーション誘導変換器UNetモデルであるMicroSegNetを提案する。
トレーニングプロセスでは、microsegnetは、専門家と非専門家のアノテーションの相違を特徴とする、(ハードな領域)セグメンテーションが難しい領域にフォーカスしている。
我々は、ハード領域における予測誤差に重みを割り当て、容易領域における予測誤差に低重みを割り当てるアノテーション誘導二元交叉エントロピー(AG-BCE)損失を提案する。
AG-BCEの損失は、マルチスケールの深層監視を利用することで、トレーニングプロセスにシームレスに統合され、MicroSegNetはグローバルなコンテキスト依存やローカル情報をさまざまなスケールでキャプチャできるようになりました。
55例のmicro-US画像を用いてモデルを訓練し,20例の評価を行った。
我々のMicroSegNetモデルでは、Dice係数0.942とHausdorff距離2.11mmを達成し、いくつかの最先端セグメンテーション法と、異なる経験レベルの3つのアノテータを上回りました。
コードとデータセットを公開して、研究における透明性とコラボレーションを促進するつもりです。
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