論文の概要: Enrichment of the NLST and NSCLC-Radiomics computed tomography
collections with AI-derived annotations
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.00150v1
- Date: Wed, 31 May 2023 19:46:18 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-02 19:38:39.570017
- Title: Enrichment of the NLST and NSCLC-Radiomics computed tomography
collections with AI-derived annotations
- Title(参考訳): NLSTおよびNSCLC-Radiomics計算トモグラフィーコレクションのAI由来アノテーションによる強化
- Authors: Deepa Krishnaswamy, Dennis Bontempi, Vamsi Thiriveedhi, Davide Punzo,
David Clunie, Christopher P Bridge, Hugo JWL Aerts, Ron Kikinis, Andrey
Fedorov
- Abstract要約: 胸部CT画像, NSCLC-Radiomics, NSCLC-Radiomics と National Lung Screening Trial の2つのコレクションにAI生成アノテーションを導入する。
結果として得られたアノテーションはNCI Imaging Data Commons (IDC)で公開されており、DICOMフォーマットはデータを調和させ、FAIR原則を達成するために使用される。
この研究は、大規模でパブリックにキュレートされたデータセットの必要性を強化し、AIががんイメージングにどのように役立つかを実証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.16863755729554886
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Public imaging datasets are critical for the development and evaluation of
automated tools in cancer imaging. Unfortunately, many do not include
annotations or image-derived features, complicating their downstream analysis.
Artificial intelligence-based annotation tools have been shown to achieve
acceptable performance and thus can be used to automatically annotate large
datasets. As part of the effort to enrich public data available within NCI
Imaging Data Commons (IDC), here we introduce AI-generated annotations for two
collections of computed tomography images of the chest, NSCLC-Radiomics, and
the National Lung Screening Trial. Using publicly available AI algorithms we
derived volumetric annotations of thoracic organs at risk, their corresponding
radiomics features, and slice-level annotations of anatomical landmarks and
regions. The resulting annotations are publicly available within IDC, where the
DICOM format is used to harmonize the data and achieve FAIR principles. The
annotations are accompanied by cloud-enabled notebooks demonstrating their use.
This study reinforces the need for large, publicly accessible curated datasets
and demonstrates how AI can be used to aid in cancer imaging.
- Abstract(参考訳): 公共画像データセットは、癌画像における自動化ツールの開発と評価に重要である。
残念なことに、多くのものはアノテーションや画像由来の機能を含んでおらず、下流の分析を複雑にしている。
人工知能ベースのアノテーションツールは許容可能なパフォーマンスを達成するために示されており、大規模なデータセットの自動アノテートに使用できる。
NCI Imaging Data Commons (IDC) の公開データを充実させる取り組みの一環として, 胸部CT画像, NSCLC-Radiomics, National Lung Screening Trialの2つのコレクションに対するAI生成アノテーションを紹介する。
公開されているAIアルゴリズムを使用して、胸部臓器のボリュームアノテーション、それに対応する放射線特性、解剖学的ランドマークと領域のスライスレベルアノテーションを抽出した。
結果として得られたアノテーションはIDC内で公開されており、DICOMフォーマットはデータを調和させ、FAIR原則を達成するために使用される。
アノテーションにはクラウド対応ノートブックが添付されている。
この研究は、大規模で一般公開されたキュレートされたデータセットの必要性を強化し、AIががんイメージングにどのように役立つかを実証する。
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