論文の概要: Lumbar spine segmentation in MR images: a dataset and a public benchmark
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.12217v3
- Date: Tue, 5 Mar 2024 08:56:06 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-07 03:19:46.534251
- Title: Lumbar spine segmentation in MR images: a dataset and a public benchmark
- Title(参考訳): MR画像における腰椎椎間板分割 : データセットと公開ベンチマーク
- Authors: Jasper W. van der Graaf, Miranda L. van Hooff, Constantinus F. M.
Buckens, Matthieu Rutten, Job L. C. van Susante, Robert Jan Kroeze, Marinus
de Kleuver, Bram van Ginneken, Nikolas Lessmann
- Abstract要約: 本稿では,多心性腰椎MRI(Multi-center lumbar spine magnetic resonance imaging)データセットについて述べる。
このデータセットには、腰痛の既往歴を持つ218人の患者から447個の矢状T1とT2MRIシリーズが含まれている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.768537261519943
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: This paper presents a large publicly available multi-center lumbar spine
magnetic resonance imaging (MRI) dataset with reference segmentations of
vertebrae, intervertebral discs (IVDs), and spinal canal. The dataset includes
447 sagittal T1 and T2 MRI series from 218 patients with a history of low back
pain and was collected from four different hospitals. An iterative data
annotation approach was used by training a segmentation algorithm on a small
part of the dataset, enabling semi-automatic segmentation of the remaining
images. The algorithm provided an initial segmentation, which was subsequently
reviewed, manually corrected, and added to the training data. We provide
reference performance values for this baseline algorithm and nnU-Net, which
performed comparably. Performance values were computed on a sequestered set of
39 studies with 97 series, which were additionally used to set up a continuous
segmentation challenge that allows for a fair comparison of different
segmentation algorithms. This study may encourage wider collaboration in the
field of spine segmentation and improve the diagnostic value of lumbar spine
MRI.
- Abstract(参考訳): 本稿では, 椎間板, 椎間板, 脊柱管を基準とした多中心性腰椎磁気共鳴画像(mri)データセットを提案する。
このデータセットには、腰痛の歴史を持つ218人の患者から447個の矢状T1とT2MRIシリーズが含まれ、4つの異なる病院から収集された。
反復的なデータアノテーションアプローチは、データセットの小さな部分にセグメンテーションアルゴリズムをトレーニングすることで、残りの画像の半自動セグメンテーションを可能にする。
アルゴリズムは初期セグメンテーションを提供し、その後レビューされ、手動で修正され、トレーニングデータに追加された。
本稿では,本アルゴリズムと nnU-Net の基準性能値について比較検討する。
97の系列を持つ39の研究で性能値が計算され、これはさらに、異なるセグメンテーションアルゴリズムの公正な比較を可能にする連続セグメンテーションチャレンジのセットアップに使用された。
本研究は腰椎椎間板分割の分野におけるより広範なコラボレーションを促進し,腰椎mriの診断価値を向上させる。
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