論文の概要: Concurrent ischemic lesion age estimation and segmentation of CT brain
using a Transformer-based network
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.12242v1
- Date: Wed, 21 Jun 2023 13:00:49 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-22 13:29:40.677509
- Title: Concurrent ischemic lesion age estimation and segmentation of CT brain
using a Transformer-based network
- Title(参考訳): Transformer-based network を用いたCT脳の虚血性病変年齢推定とセグメンテーション
- Authors: Adam Marcus, Paul Bentley, Daniel Rueckert
- Abstract要約: 本稿では,脳虚血病変の同時分節と年齢推定に最適化された,エンドツーエンドのマルチタスク・トランスフォーマー・ネットワークを提案する。
従来手法の0.858と比較すると, 病変年齢を4.5時間に分類するための曲線(AUC)が0.933未満の領域で, 有望な性能が得られる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.80381582892208
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The cornerstone of stroke care is expedient management that varies depending
on the time since stroke onset. Consequently, clinical decision making is
centered on accurate knowledge of timing and often requires a radiologist to
interpret Computed Tomography (CT) of the brain to confirm the occurrence and
age of an event. These tasks are particularly challenging due to the subtle
expression of acute ischemic lesions and the dynamic nature of their
appearance. Automation efforts have not yet applied deep learning to estimate
lesion age and treated these two tasks independently, so, have overlooked their
inherent complementary relationship. To leverage this, we propose a novel
end-to-end multi-task transformer-based network optimized for concurrent
segmentation and age estimation of cerebral ischemic lesions. By utilizing
gated positional self-attention and CT-specific data augmentation, the proposed
method can capture long-range spatial dependencies while maintaining its
ability to be trained from scratch under low-data regimes commonly found in
medical imaging. Furthermore, to better combine multiple predictions, we
incorporate uncertainty by utilizing quantile loss to facilitate estimating a
probability density function of lesion age. The effectiveness of our model is
then extensively evaluated on a clinical dataset consisting of 776 CT images
from two medical centers. Experimental results demonstrate that our method
obtains promising performance, with an area under the curve (AUC) of 0.933 for
classifying lesion ages <=4.5 hours compared to 0.858 using a conventional
approach, and outperforms task-specific state-of-the-art algorithms.
- Abstract(参考訳): 脳卒中治療の基盤は、脳卒中発症以来の時間によって異なる迅速な管理である。
その結果、臨床的意思決定はタイミングの正確な知識に重点を置いており、しばしば、脳のCT(Computed Tomography)を解釈して事象の発生と年齢を確認する必要がある。
これらの課題は、急性虚血性病変の微妙な発現と、その外観の動的な性質によって特に困難である。
自動化の取り組みはまだ、病変年齢を推定するためにディープラーニングを適用しておらず、これら2つのタスクを個別に扱っているため、それら固有の相補的関係を見落としている。
これを活用するために,脳虚血病変の同時セグメンテーションと年齢推定に最適化された新しいエンドツーエンドマルチタスクトランスフォーマーネットワークを提案する。
本手法は, 医用画像によく見られる低データ体制下で, スクラッチからトレーニングする能力を維持しつつ, 長距離空間依存性を捉えることができる。
さらに,複数の予測をうまく組み合わせるために,質的損失を利用して不確かさを取り入れ,病変年齢の確率密度関数を推定する。
このモデルの有効性を,2つの医療センターの776個のCT画像からなる臨床データセットで評価した。
実験の結果,従来手法の0.858と比較すると,病変年齢<=4.5時間>の曲線(AUC)が0.933未満の領域で有望な性能を示し,タスク固有の最先端アルゴリズムよりも優れていた。
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