論文の概要: Pseudo-Bag Mixup Augmentation for Multiple Instance Learning Based Whole
Slide Image Classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.16180v1
- Date: Wed, 28 Jun 2023 13:02:30 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-29 14:05:27.263649
- Title: Pseudo-Bag Mixup Augmentation for Multiple Instance Learning Based Whole
Slide Image Classification
- Title(参考訳): 複数インスタンス学習に基づく全スライド画像分類のための疑似バッグミックスアップ拡張
- Authors: Pei Liu, Luping Ji, Xinyu Zhang, Feng Ye
- Abstract要約: 本稿では,MILモデルのトレーニングを改善するために,Pseudo-bag Mixup (PseMix)データ拡張方式を提案する。
PseMixはWSI分類におけるMILネットワークの性能を向上させることができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.73187183084554
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Given the special situation of modeling gigapixel images, multiple instance
learning (MIL) has become one of the most important frameworks for Whole Slide
Image (WSI) classification. In current practice, most MIL networks often face
two unavoidable problems in training: i) insufficient WSI data, and ii) the
data memorization nature inherent in neural networks. These problems may hinder
MIL models from adequate and efficient training, suppressing the continuous
performance promotion of classification models on WSIs. Inspired by the basic
idea of Mixup, this paper proposes a Pseudo-bag Mixup (PseMix) data
augmentation scheme to improve the training of MIL models. This scheme
generalizes the Mixup strategy for general images to special WSIs via
pseudo-bags so as to be applied in MIL-based WSI classification. Cooperated by
pseudo-bags, our PseMix fulfills the critical size alignment and semantic
alignment in Mixup strategy. Moreover, it is designed as an efficient and
decoupled method adaptive to MIL, neither involving time-consuming operations
nor relying on MIL model predictions. Comparative experiments and ablation
studies are specially designed to evaluate the effectiveness and advantages of
our PseMix. Test results show that PseMix could often improve the performance
of MIL networks in WSI classification. Besides, it could also boost the
generalization capacity of MIL models, and promote their robustness to patch
occlusion and noisy labels. Our source code is available at
https://github.com/liupei101/PseMix.
- Abstract(参考訳): ギガピクセル画像のモデリングの特別な状況を考えると、MIL(Multiple Case Learning)はWSI(Whole Slide Image)分類において最も重要なフレームワークの1つとなっている。
現在、ほとんどのMILネットワークは、トレーニングにおいて避けられない2つの問題に直面している。
i) 不十分なWSIデータ及び
二 ニューラルネットワークに固有のデータ記憶の性質
これらの問題は、WSIの分類モデルの継続的な性能向上を抑えるため、MILモデルが適切かつ効率的な訓練から妨げられる可能性がある。
そこで本研究では,MILモデルのトレーニングを改善するためのPseudo-bag Mixup(PseMix)データ拡張スキームを提案する。
このスキームは、MILに基づくWSI分類に適用するために、一般的な画像のMixup戦略を擬似バグを介して特別なWSIに一般化する。
疑似バッグによる協調により,psemixはミックスアップ戦略におけるクリティカルサイズアライメントとセマンティクスアライメントを満足する。
さらに、MILに適応した効率的で分離された手法として設計されており、時間を要する操作やMILモデル予測に依存しない。
比較実験とアブレーション研究はPseMixの有効性と利点を評価するために特別に設計されている。
PseMixはWSI分類におけるMILネットワークの性能を向上させることができる。
さらに、MILモデルの一般化能力を高め、排他的ラベルやノイズのあるラベルをパッチする堅牢性を促進することもできる。
ソースコードはhttps://github.com/liupei101/psemixで入手できます。
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