論文の概要: SUGAR: Spherical Ultrafast Graph Attention Framework for Cortical
Surface Registration
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.00511v1
- Date: Sun, 2 Jul 2023 08:19:15 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-05 15:35:21.270291
- Title: SUGAR: Spherical Ultrafast Graph Attention Framework for Cortical
Surface Registration
- Title(参考訳): SUGAR: 皮質表面登録のための球面超高速グラフ注意フレームワーク
- Authors: Jianxun Ren, Ning An, Youjia Zhang, Danyang Wang, Zhenyu Sun, Cong
Lin, Weigang Cui, Weiwei Wang, Ying Zhou, Wei Zhang, Qingyu Hu, Ping Zhang,
Dan Hu, Danhong Wang, Hesheng Liu
- Abstract要約: 皮質表面の登録は、個人間で皮質の機能的特徴と解剖学的特徴の整合において重要な役割を担っている。
近年,学習ベースの登録アルゴリズムが有望なソリューションとして登場している。
我々は,厳密な登録と非厳密な登録のための統一された教師なしディープラーニングフレームワークSUGARを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 15.606186190173883
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Cortical surface registration plays a crucial role in aligning cortical
functional and anatomical features across individuals. However, conventional
registration algorithms are computationally inefficient. Recently,
learning-based registration algorithms have emerged as a promising solution,
significantly improving processing efficiency. Nonetheless, there remains a gap
in the development of a learning-based method that exceeds the state-of-the-art
conventional methods simultaneously in computational efficiency, registration
accuracy, and distortion control, despite the theoretically greater
representational capabilities of deep learning approaches. To address the
challenge, we present SUGAR, a unified unsupervised deep-learning framework for
both rigid and non-rigid registration. SUGAR incorporates a U-Net-based
spherical graph attention network and leverages the Euler angle representation
for deformation. In addition to the similarity loss, we introduce fold and
multiple distortion losses, to preserve topology and minimize various types of
distortions. Furthermore, we propose a data augmentation strategy specifically
tailored for spherical surface registration, enhancing the registration
performance. Through extensive evaluation involving over 10,000 scans from 7
diverse datasets, we showed that our framework exhibits comparable or superior
registration performance in accuracy, distortion, and test-retest reliability
compared to conventional and learning-based methods. Additionally, SUGAR
achieves remarkable sub-second processing times, offering a notable speed-up of
approximately 12,000 times in registering 9,000 subjects from the UK Biobank
dataset in just 32 minutes. This combination of high registration performance
and accelerated processing time may greatly benefit large-scale neuroimaging
studies.
- Abstract(参考訳): 皮質表面の登録は、個人間の皮質機能的および解剖学的特徴の調整において重要な役割を担っている。
しかし、従来の登録アルゴリズムは計算的に非効率である。
近年,学習に基づく登録アルゴリズムが有望なソリューションとして登場し,処理効率が大幅に向上した。
それでも、ディープラーニングアプローチの理論的により大きな表現能力にもかかわらず、計算効率、登録精度、歪み制御を同時に行う最先端の手法を超える学習ベースの手法の開発にはギャップがある。
この課題に対処するために,厳密な登録と非厳密な登録のための統一された教師なしディープラーニングフレームワークSUGARを提案する。
SUGARはU-Netベースの球面グラフアテンションネットワークを導入し、変形にオイラー角表現を利用する。
類似性損失に加えて,折りたたみと多重歪み損失を導入し,トポロジーを保ち,様々な種類の歪みを最小化する。
さらに,球面登録用に特別に調整したデータ拡張戦略を提案し,登録性能を向上させる。
7つの多種多様なデータセットから1万以上のスキャンを行った結果,従来の手法や学習に基づく手法と比較して,精度,歪み,テスト-テスト信頼性において同等か優れた登録性能を示した。
さらにsugarは、驚くべきサブ秒処理時間を達成し、英国のバイオバンクデータセットから9000人の被験者をわずか32分で登録することで、約12,000回のスピードアップを実現している。
この高い登録性能と高速化された処理時間の組み合わせは、大規模な神経画像研究に大いに役立つかもしれない。
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