論文の概要: An Explainable Geometric-Weighted Graph Attention Network for
Identifying Functional Networks Associated with Gait Impairment
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.13108v1
- Date: Mon, 24 Jul 2023 19:57:21 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-26 19:03:47.451521
- Title: An Explainable Geometric-Weighted Graph Attention Network for
Identifying Functional Networks Associated with Gait Impairment
- Title(参考訳): 歩行障害に関連する機能的ネットワーク同定のための幾何学的重み付けグラフ注意ネットワーク
- Authors: Favour Nerrise (1), Qingyu Zhao (2), Kathleen L. Poston (3), Kilian M.
Pohl (2), Ehsan Adeli (2) ((1) Department of Electrical Engineering, Stanford
University, Stanford, CA, USA, (2) Dept. of Psychiatry and Behavioral
Sciences, Stanford University, Stanford, CA, USA, (3) Dept. of Neurology and
Neurological Sciences, Stanford University, Stanford, CA, USA)
- Abstract要約: パーキンソン病(PD)の徴候の1つは、後部反射の進行性消失である。
歩行障害に伴う脳機能障害の特定は、PD運動の進行をよりよく理解するために重要である。
本稿では,歩行障害の進行を予測した機能的ネットワークを特定するための,説明可能な,幾何学的,重み付けされた注目型ニューラルネットワーク(xGW-GAT)を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: One of the hallmark symptoms of Parkinson's Disease (PD) is the progressive
loss of postural reflexes, which eventually leads to gait difficulties and
balance problems. Identifying disruptions in brain function associated with
gait impairment could be crucial in better understanding PD motor progression,
thus advancing the development of more effective and personalized therapeutics.
In this work, we present an explainable, geometric, weighted-graph attention
neural network (xGW-GAT) to identify functional networks predictive of the
progression of gait difficulties in individuals with PD. xGW-GAT predicts the
multi-class gait impairment on the MDS Unified PD Rating Scale (MDS-UPDRS). Our
computational- and data-efficient model represents functional connectomes as
symmetric positive definite (SPD) matrices on a Riemannian manifold to
explicitly encode pairwise interactions of entire connectomes, based on which
we learn an attention mask yielding individual- and group-level explainability.
Applied to our resting-state functional MRI (rs-fMRI) dataset of individuals
with PD, xGW-GAT identifies functional connectivity patterns associated with
gait impairment in PD and offers interpretable explanations of functional
subnetworks associated with motor impairment. Our model successfully
outperforms several existing methods while simultaneously revealing
clinically-relevant connectivity patterns. The source code is available at
https://github.com/favour-nerrise/xGW-GAT .
- Abstract(参考訳): パーキンソン病(PD)の徴候の1つは、姿勢反射の進行的な消失であり、最終的には歩行困難とバランスの問題を引き起こす。
歩行障害に伴う脳機能障害の同定は、pd運動の進行の理解を深める上で不可欠であり、それによってより効果的でパーソナライズされた治療法の開発が進められる。
本研究では,MDS統一PDレーティング尺度(MDS-UPDRS)において,PD患者の歩行障害の進行を予測した機能的ネットワークを特定するための,説明可能な,幾何学的,重み付けされた注目ニューラルネットワーク(xGW-GAT)を提案する。
我々の計算とデータ効率のモデルでは、関数コネクトームをリーマン多様体上の対称正定値(SPD)行列として表現し、コネクトーム全体の対相互作用を明示的にエンコードする。
pdを有する個人の安静時機能mri(rs-fmri)データセットに適用し、xgw-gatはpdにおける歩行障害に関連する機能的接続パターンを特定し、運動障害に関連する機能的サブネットワークの解釈可能な説明を提供する。
本モデルは,臨床関連接続パターンを同時に明らかにしつつ,いくつかの既存手法より優れている。
ソースコードはhttps://github.com/favour-nerrise/xGW-GAT で公開されている。
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