論文の概要: RadGraph2: Modeling Disease Progression in Radiology Reports via
Hierarchical Information Extraction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.05046v1
- Date: Wed, 9 Aug 2023 16:19:43 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-08-10 13:04:50.438612
- Title: RadGraph2: Modeling Disease Progression in Radiology Reports via
Hierarchical Information Extraction
- Title(参考訳): RadGraph2:階層的情報抽出による放射線医学報告における疾患進展のモデル化
- Authors: Sameer Khanna, Adam Dejl, Kibo Yoon, Quoc Hung Truong, Hanh Duong,
Agustina Saenz, Pranav Rajpurkar
- Abstract要約: RadGraph2は,放射線学報告から情報を取り出すための新しいデータセットである。
階層的なスキーマを導入し、それらの関係に基づいてエンティティを整理し、トレーニング中にこの階層を使用すると、情報抽出モデルの性能が向上することを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.257865347624134
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We present RadGraph2, a novel dataset for extracting information from
radiology reports that focuses on capturing changes in disease state and device
placement over time. We introduce a hierarchical schema that organizes entities
based on their relationships and show that using this hierarchy during training
improves the performance of an information extraction model. Specifically, we
propose a modification to the DyGIE++ framework, resulting in our model HGIE,
which outperforms previous models in entity and relation extraction tasks. We
demonstrate that RadGraph2 enables models to capture a wider variety of
findings and perform better at relation extraction compared to those trained on
the original RadGraph dataset. Our work provides the foundation for developing
automated systems that can track disease progression over time and develop
information extraction models that leverage the natural hierarchy of labels in
the medical domain.
- Abstract(参考訳): radgraph2は,疾患状態の変化やデバイス配置の経時的変化を捉えることに焦点を当てた,放射線レポートから情報を抽出する新しいデータセットである。
本稿では,その関係に基づいてエンティティを整理する階層スキーマを導入し,トレーニング中にこの階層を用いることで情報抽出モデルの性能が向上することを示す。
具体的には、dygie++フレームワークの修正を提案し、エンティティおよび関係抽出タスクで従来のモデルを上回るモデルhgieを作成しました。
RadGraph2は、オリジナルのRadGraphデータセットでトレーニングされたモデルと比較して、より広範なさまざまな発見をキャプチャし、関係抽出において優れたパフォーマンスを発揮することを実証する。
我々の研究は、疾患の進行を追跡し、医療領域におけるラベルの自然な階層を活用できる情報抽出モデルを開発するための基盤を提供する。
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