論文の概要: Source-Free Collaborative Domain Adaptation via Multi-Perspective
Feature Enrichment for Functional MRI Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.12495v1
- Date: Thu, 24 Aug 2023 01:30:18 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-08-25 15:44:39.974451
- Title: Source-Free Collaborative Domain Adaptation via Multi-Perspective
Feature Enrichment for Functional MRI Analysis
- Title(参考訳): 機能的MRI解析のための多視点特徴強調によるソースフリー協調領域適応
- Authors: Yuqi Fang, Jinjian Wu, Qianqian Wang, Shijun Qiu, Andrea Bozoki,
Huaicheng Yan, Mingxia Liu
- Abstract要約: 安静時MRI機能(rs-fMRI)は、神経疾患の分析を助けるために多地点で研究されている。
ソース領域とターゲット領域の間のfMRIの不均一性を低減するための多くの手法が提案されている。
しかし、マルチサイト研究における懸念やデータストレージの負担のため、ソースデータの取得は困難である。
我々は、fMRI解析のためのソースフリー協調ドメイン適応フレームワークを設計し、事前訓練されたソースモデルとラベルなしターゲットデータのみにアクセスできるようにする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 55.03872260158717
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Resting-state functional MRI (rs-fMRI) is increasingly employed in multi-site
research to aid neurological disorder analysis. Existing studies usually suffer
from significant cross-site/domain data heterogeneity caused by site effects
such as differences in scanners/protocols. Many methods have been proposed to
reduce fMRI heterogeneity between source and target domains, heavily relying on
the availability of source data. But acquiring source data is challenging due
to privacy concerns and/or data storage burdens in multi-site studies. To this
end, we design a source-free collaborative domain adaptation (SCDA) framework
for fMRI analysis, where only a pretrained source model and unlabeled target
data are accessible. Specifically, a multi-perspective feature enrichment
method (MFE) is developed for target fMRI analysis, consisting of multiple
collaborative branches to dynamically capture fMRI features of unlabeled target
data from multiple views. Each branch has a data-feeding module, a
spatiotemporal feature encoder, and a class predictor. A mutual-consistency
constraint is designed to encourage pair-wise consistency of latent features of
the same input generated from these branches for robust representation
learning. To facilitate efficient cross-domain knowledge transfer without
source data, we initialize MFE using parameters of a pretrained source model.
We also introduce an unsupervised pretraining strategy using 3,806 unlabeled
fMRIs from three large-scale auxiliary databases, aiming to obtain a general
feature encoder. Experimental results on three public datasets and one private
dataset demonstrate the efficacy of our method in cross-scanner and cross-study
prediction tasks. The model pretrained on large-scale rs-fMRI data has been
released to the public.
- Abstract(参考訳): 安静時機能MRI(rs-fMRI)は、神経疾患の分析を助けるために多地点で研究されている。
既存の研究は通常、スキャナー/プロトコールの違いなどのサイト効果によって生じる重要なクロスサイト/ドメインデータの異種性に悩まされる。
ソースデータの可用性に大きく依存して、ソースドメインとターゲットドメイン間のfMRIの不均一性を低減するための多くの手法が提案されている。
しかし、複数サイト研究におけるプライバシーの懸念やデータストレージの負担から、ソースデータを取得することは困難である。
この目的のために、fMRI解析のためのソースフリーコラボレーティブドメイン適応(SCDA)フレームワークを設計し、事前訓練されたソースモデルと未ラベルのターゲットデータのみにアクセスできるようにする。
具体的には,マルチパースペクティブ・フィーチャー・エンリッチメント法 (MFE) を対象fMRI解析のために開発し,複数ビューからラベル付けされていない対象データのfMRI特徴を動的にキャプチャする。
各ブランチには、データフィードモジュール、時空間機能エンコーダ、クラス予測器がある。
相互整合性制約は、堅牢な表現学習のためにこれらの分岐から生成された同じ入力の潜在特徴のペアワイズ整合性を促進するように設計されている。
ソースデータのない効率的なドメイン間知識伝達を容易にするため,事前学習したソースモデルのパラメータを用いてMFEを初期化する。
また,3つの大規模補助データベースから3,806個のラベル付きfmriを用いた教師なし事前学習戦略を導入する。
3つの公開データセットと1つのプライベートデータセットの実験結果から,クロススキャナおよびクロススタディ予測タスクにおける本手法の有効性が示された。
大規模rs-fmriデータで事前トレーニングされたモデルが公開された。
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