論文の概要: Bang and the Artefacts are Gone! Rapid Artefact Removal and Tissue
Segmentation in Haematoxylin and Eosin Stained Biopsies
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.13304v1
- Date: Fri, 25 Aug 2023 11:04:35 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-08-28 14:23:19.121957
- Title: Bang and the Artefacts are Gone! Rapid Artefact Removal and Tissue
Segmentation in Haematoxylin and Eosin Stained Biopsies
- Title(参考訳): バンとアーティファクトが消えた!
ヘマトキシリンおよびエオシン染色生検における急速アーティファクト除去と組織分画
- Authors: B. A. Schreiber, J. Denholm, F. Jaeckle, M. J. Arends, K. M. Branson,
C.-B. Sch\"onlieb, E. J. Soilleux
- Abstract要約: 我々は,全スライディング画像(WSI)における組織を迅速検出するためのH&E大津しきい値作成手法を提案する。
本手法では, 簡易な大津しきい値設定により, 背景および人工物から組織を分離できる低画像化RGB概要画像の入札モーダル表現を得る。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: We present H&E Otsu thresholding, a scheme for rapidly detecting tissue in
whole-slide images (WSIs) that eliminates a wide range of undesirable artefacts
such as pen marks and scanning artefacts. Our method involves obtaining a
bid-modal representation of a low-magnification RGB overview image which
enables simple Otsu thresholding to separate tissue from background and
artefacts. We demonstrate our method on WSIs prepared from a wide range of
institutions and WSI digital scanners, each containing substantial artefacts
that cause other methods to fail. The beauty of our approach lies in its
simplicity: manipulating RGB colour space and using Otsu thresholding allows
for the rapid removal of artefacts and segmentation of tissue.
- Abstract(参考訳): 本稿では,ペンマークや走査型アーティファクトなど,幅広い望ましくないアーティファクトを除去する,全スライディング画像(WSI)の組織を迅速検出する手法であるH&E Otsu thresholdingを提案する。
本手法では, 簡易な大津しきい値設定により, 背景および人工物から組織を分離できる低画像化RGB概要画像の入札モーダル表現を得る。
提案手法は,多種多様な機関とwsiデジタルスキャナから作成され,それぞれに他の手法に障害をもたらす実質的なアーティファクトが含まれていることを実証する。
われわれのアプローチの美しさは、RGB色空間の操作と大津しきい値の操作により、アーティファクトの迅速な除去と組織のセグメンテーションが可能になります。
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