論文の概要: Iterative Semi-Supervised Learning for Abdominal Organs and Tumor
Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2310.01159v1
- Date: Mon, 2 Oct 2023 12:45:13 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-10-04 21:51:23.985385
- Title: Iterative Semi-Supervised Learning for Abdominal Organs and Tumor
Segmentation
- Title(参考訳): 腹部臓器と腫瘍切開の反復的半監督学習
- Authors: Jiaxin Zhuang and Luyang Luo and Zhixuan Chen, and Linshan Wu
- Abstract要約: FLARE23チャレンジは、部分的データと完全注釈付きデータの両方を備えた大規模なデータセットを提供する。
我々は、FLARE23に対処するために、Semi-Supervised Learning(SSL)と反復的な擬似ラベリングの戦略を用いることを提案する。
本手法では, 臓器の平均DSCスコアは89.63%, 腫瘍は46.07%である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.952008176585512
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Deep-learning (DL) based methods are playing an important role in the task of
abdominal organs and tumors segmentation in CT scans. However, the large
requirements of annotated datasets heavily limit its development. The FLARE23
challenge provides a large-scale dataset with both partially and fully
annotated data, which also focuses on both segmentation accuracy and
computational efficiency. In this study, we propose to use the strategy of
Semi-Supervised Learning (SSL) and iterative pseudo labeling to address
FLARE23. Initially, a deep model (nn-UNet) trained on datasets with complete
organ annotations (about 220 scans) generates pseudo labels for the whole
dataset. These pseudo labels are then employed to train a more powerful
segmentation model. Employing the FLARE23 dataset, our approach achieves an
average DSC score of 89.63% for organs and 46.07% for tumors on online
validation leaderboard. For organ segmentation, We obtain 0.9007\% DSC and
0.9493\% NSD. For tumor segmentation, we obtain 0.3785% DSC and 0.2842% NSD.
Our code is available at https://github.com/USTguy/Flare23.
- Abstract(参考訳): 深層学習(DL)に基づく手法は,CTスキャンにおける腹部臓器と腫瘍の分節化において重要な役割を担っている。
しかし、注釈付きデータセットの大きな要求は、その開発を著しく制限する。
FLARE23チャレンジは、部分的データと完全注釈付きデータの両方を備えた大規模なデータセットを提供し、セグメンテーションの精度と計算効率の両方に焦点を当てている。
本研究では,FLARE23に対処するために,半教師付き学習(SSL)と反復的な擬似ラベリングの戦略を提案する。
当初は、完全な臓器アノテーション(約220スキャン)を備えたデータセットでトレーニングされたディープモデル(nn-UNet)が、データセット全体の擬似ラベルを生成する。
これらの擬似ラベルは、より強力なセグメンテーションモデルをトレーニングするために使用される。
FLARE23データセットを用いることで、臓器の平均DSCスコアは89.63%、オンラインバリデーションリーダーボードでは46.07%となる。
臓器セグメンテーションでは, 0.9007\% DSC と 0.9493\% NSD が得られた。
腫瘍セグメンテーションでは0.3785%のDSCと0.2842%のSDが得られた。
私たちのコードはhttps://github.com/ustguy/flare23で利用可能です。
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