論文の概要: Towards Robust Cardiac Segmentation using Graph Convolutional Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2310.01210v5
- Date: Tue, 2 Jul 2024 09:31:04 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-04 08:20:17.466785
- Title: Towards Robust Cardiac Segmentation using Graph Convolutional Networks
- Title(参考訳): グラフ畳み込みネットワークを用いたロバスト心分離に向けて
- Authors: Gilles Van De Vyver, Sarina Thomas, Guy Ben-Yosef, Sindre Hellum Olaisen, Håvard Dalen, Lasse Løvstakken, Erik Smistad,
- Abstract要約: 本稿では,心解剖学に基づく2つの畳み込み環を用いたグラフアーキテクチャを提案する。
この予測器は,分布外および不適な入力画像をリアルタイムに検出できることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.9507020058422264
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Fully automatic cardiac segmentation can be a fast and reproducible method to extract clinical measurements from an echocardiography examination. The U-Net architecture is the current state-of-the-art deep learning architecture for medical segmentation and can segment cardiac structures in real-time with average errors comparable to inter-observer variability. However, this architecture still generates large outliers that are often anatomically incorrect. This work uses the concept of graph convolutional neural networks that predict the contour points of the structures of interest instead of labeling each pixel. We propose a graph architecture that uses two convolutional rings based on cardiac anatomy and show that this eliminates anatomical incorrect multi-structure segmentations on the publicly available CAMUS dataset. Additionally, this work contributes with an ablation study on the graph convolutional architecture and an evaluation of clinical measurements on the clinical HUNT4 dataset. Finally, we propose to use the inter-model agreement of the U-Net and the graph network as a predictor of both the input and segmentation quality. We show this predictor can detect out-of-distribution and unsuitable input images in real-time. Source code is available online: https://github.com/gillesvntnu/GCN_multistructure
- Abstract(参考訳): 完全自動心筋分画は、心エコー検査から臨床測定を抽出するための、迅速かつ再現可能な方法である。
U-Netアーキテクチャは、現在最先端の医用セグメンテーションのためのディープラーニングアーキテクチャであり、心臓構造をリアルタイムで分割でき、平均エラーはサーバ間変動に匹敵する。
しかし、このアーキテクチャは、しばしば解剖学的に正しくない大きな外れ値を生成する。
この研究はグラフ畳み込みニューラルネットワークの概念を用いて、各ピクセルをラベル付けするのではなく、興味のある構造の輪郭点を予測する。
本稿では,心解剖学に基づく2つの畳み込みリングを用いたグラフアーキテクチャを提案する。
さらに、この研究は、グラフ畳み込みアーキテクチャに関するアブレーション研究と、臨床HUNT4データセットに関する臨床測定の評価に寄与する。
最後に,U-Netとグラフネットワークのモデル間合意を,入力品質とセグメンテーション品質の両方の予測器として用いることを提案する。
この予測器は,分布外および不適な入力画像をリアルタイムに検出できることを示す。
ソースコードはオンラインで入手できる。 https://github.com/gillesvntnu/GCN_multistructure
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