論文の概要: A Learnable Counter-condition Analysis Framework for Functional
Connectivity-based Neurological Disorder Diagnosis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2310.03964v1
- Date: Fri, 6 Oct 2023 01:33:47 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-10-10 03:41:56.716190
- Title: A Learnable Counter-condition Analysis Framework for Functional
Connectivity-based Neurological Disorder Diagnosis
- Title(参考訳): 機能的結合型神経疾患診断のための学習可能な条件解析フレームワーク
- Authors: Eunsong Kang, Da-woon Heo, Jiwon Lee, Heung-Il Suk
- Abstract要約: 本稿では,診断(特徴選択と特徴抽出)と説明を体系的に統合する新しい統合フレームワークを提案する。
最後に、我々のフレームワークは、神経科学的な解釈のための新しい説明力を提供し、反条件分析とも呼ばれる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.1410193893176
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: To understand the biological characteristics of neurological disorders with
functional connectivity (FC), recent studies have widely utilized deep
learning-based models to identify the disease and conducted post-hoc analyses
via explainable models to discover disease-related biomarkers. Most existing
frameworks consist of three stages, namely, feature selection, feature
extraction for classification, and analysis, where each stage is implemented
separately. However, if the results at each stage lack reliability, it can
cause misdiagnosis and incorrect analysis in afterward stages. In this study,
we propose a novel unified framework that systemically integrates diagnoses
(i.e., feature selection and feature extraction) and explanations. Notably, we
devised an adaptive attention network as a feature selection approach to
identify individual-specific disease-related connections. We also propose a
functional network relational encoder that summarizes the global topological
properties of FC by learning the inter-network relations without pre-defined
edges between functional networks. Last but not least, our framework provides a
novel explanatory power for neuroscientific interpretation, also termed
counter-condition analysis. We simulated the FC that reverses the diagnostic
information (i.e., counter-condition FC): converting a normal brain to be
abnormal and vice versa. We validated the effectiveness of our framework by
using two large resting-state functional magnetic resonance imaging (fMRI)
datasets, Autism Brain Imaging Data Exchange (ABIDE) and REST-meta-MDD, and
demonstrated that our framework outperforms other competing methods for disease
identification. Furthermore, we analyzed the disease-related neurological
patterns based on counter-condition analysis.
- Abstract(参考訳): 機能的接続(FC)を伴う神経疾患の生物学的特徴を理解するため,近年,深層学習モデルを用いて疾患を同定し,説明可能なモデルを用いて疾患関連バイオマーカーの発見を行った。
既存のフレームワークのほとんどは、機能選択、分類のための特徴抽出、分析という3つのステージで構成されており、各ステージは別々に実装されている。
しかし, 各段階の結果に信頼性が欠如している場合には, 誤診や解析の誤りが生じる可能性がある。
本研究では,診断(特徴選択と特徴抽出)と説明を体系的に統合した新しい統一フレームワークを提案する。
特に,個別の疾患関連関係を識別するための特徴選択手法として,適応型注意ネットワークを考案した。
また,関数ネットワーク間のエッジを事前に定義することなく,ネットワーク間関係を学習することでfcのグローバルトポロジー特性を要約する関数ネットワーク関係エンコーダを提案する。
最後に、我々のフレームワークは、神経科学的な解釈のための新しい説明力を提供する。
診断情報を反転させるfcをシミュレートし, 正常な脳を異常に変換し, その逆も行う。
我々は,2つの大規模静止状態機能型磁気共鳴画像(fMRI)データセット,自閉症脳画像データ交換(ABIDE)およびREST-meta-MDDを用いて,本フレームワークの有効性を検証した。
さらに, 疾患関連神経学的パターンをカウンターコンディショニング分析に基づいて解析した。
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