論文の概要: SDF4CHD: Generative Modeling of Cardiac Anatomies with Congenital Heart
Defects
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.00332v1
- Date: Wed, 1 Nov 2023 06:50:53 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-02 14:32:30.911439
- Title: SDF4CHD: Generative Modeling of Cardiac Anatomies with Congenital Heart
Defects
- Title(参考訳): SDF4CHD : 先天性心不全を伴う心臓解剖の創成モデル
- Authors: Fanwei Kong and Sascha Stocker and Perry S. Choi and Michael Ma and
Daniel B. Ennis and Alison Marsden
- Abstract要約: 先天性心疾患(CHD)は、心臓血管構造異常のスペクトルを含む。
ディープラーニング(DL)手法は、効率的な治療計画を可能にする可能性を実証している。
しかし、CHDは稀であり、そのようなDLモデルの訓練に十分な量の患者コホートを取得することは困難である。
異なるCHDタイプで観察される心臓解剖の幅広いスペクトルを捉えるのに適したタイプと形状の異なる生成手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.7253131980161722
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Congenital heart disease (CHD) encompasses a spectrum of cardiovascular
structural abnormalities, often requiring customized treatment plans for
individual patients. Computational modeling and analysis of these unique
cardiac anatomies can improve diagnosis and treatment planning and may
ultimately lead to improved outcomes. Deep learning (DL) methods have
demonstrated the potential to enable efficient treatment planning by automating
cardiac segmentation and mesh construction for patients with normal cardiac
anatomies. However, CHDs are often rare, making it challenging to acquire
sufficiently large patient cohorts for training such DL models. Generative
modeling of cardiac anatomies has the potential to fill this gap via the
generation of virtual cohorts; however, prior approaches were largely designed
for normal anatomies and cannot readily capture the significant topological
variations seen in CHD patients. Therefore, we propose a type- and
shape-disentangled generative approach suitable to capture the wide spectrum of
cardiac anatomies observed in different CHD types and synthesize differently
shaped cardiac anatomies that preserve the unique topology for specific CHD
types. Our DL approach represents generic whole heart anatomies with CHD
type-specific abnormalities implicitly using signed distance fields (SDF) based
on CHD type diagnosis, which conveniently captures divergent anatomical
variations across different types and represents meaningful intermediate CHD
states. To capture the shape-specific variations, we then learn invertible
deformations to morph the learned CHD type-specific anatomies and reconstruct
patient-specific shapes. Our approach has the potential to augment the
image-segmentation pairs for rarer CHD types for cardiac segmentation and
generate cohorts of CHD cardiac meshes for computational simulation.
- Abstract(参考訳): 先天性心疾患(CHD)は、心臓血管構造異常のスペクトルを含み、個々の患者に対してカスタマイズされた治療計画を必要とすることが多い。
これらのユニークな心臓解剖の計算モデリングと分析は、診断と治療計画を改善し、最終的には改善する可能性がある。
深層学習 (DL) 法は, 正常心疾患患者の心臓分割とメッシュ構築を自動化し, 効率的な治療計画を可能にする可能性を実証している。
しかし、CHDは稀であり、そのようなDLモデルの訓練に十分な量の患者コホートを取得することは困難である。
心臓解剖の生成的モデリングは、仮想コホートの生成によってこのギャップを埋める可能性があるが、従来のアプローチは主に正常な解剖学のために設計されており、CHD患者で見られる重要なトポロジ的変化を容易に捉えることはできない。
そこで本研究では, 異なるchd型で観察される広いスペクトルの心臓解剖を捉え, 特定のchd型に対して特異なトポロジーを保った異なる形状の心臓解剖を合成する。
DLアプローチは,CHD型診断に基づく署名付き距離場(SDF)を用いて暗黙的にCHD型特異的異常を呈し,異なるタイプの解剖学的変動を簡便に捉え,有意な中間的CHD状態を示す。
形状特異的な変形を捉えるために, 可逆的変形を学習し, 学習したchd型特異的解剖を変形し, 患者特異的な形状を再構築する。
本手法は, 心筋セグメンテーションのための希少なCHDタイプの画像分割ペアを増強し, 計算シミュレーションのためのCHD心筋メッシュのコホートを生成する可能性を秘めている。
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