論文の概要: Stain Consistency Learning: Handling Stain Variation for Automatic
Digital Pathology Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.06552v1
- Date: Sat, 11 Nov 2023 12:00:44 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-14 17:54:53.345377
- Title: Stain Consistency Learning: Handling Stain Variation for Automatic
Digital Pathology Segmentation
- Title(参考訳): Stain Consistency Learning: 自動デジタル病理分類のためのStain Variationの扱い
- Authors: Michael Yeung, Todd Watts, Sean YW Tan, Pedro F. Ferreira, Andrew D.
Scott, Sonia Nielles-Vallespin, Guang Yang
- Abstract要約: 染色色不変の特徴を学習するために,染色特異的増色と染色一貫性損失関数を組み合わせた新しいフレームワークを提案する。
マソンのトリクロマトクロムとH&E染色細胞と核データセットの10つの手法を比較した。
その結果,染色法は同等あるいは悪い性能を示したが,染色法や染色法では性能が向上した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.2386272343130127
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Stain variation is a unique challenge associated with automated analysis of
digital pathology. Numerous methods have been developed to improve the
robustness of machine learning methods to stain variation, but comparative
studies have demonstrated limited benefits to performance. Moreover, methods to
handle stain variation were largely developed for H&E stained data, with
evaluation generally limited to classification tasks. Here we propose Stain
Consistency Learning, a novel framework combining stain-specific augmentation
with a stain consistency loss function to learn stain colour invariant
features. We perform the first, extensive comparison of methods to handle stain
variation for segmentation tasks, comparing ten methods on Masson's trichrome
and H&E stained cell and nuclei datasets, respectively. We observed that stain
normalisation methods resulted in equivalent or worse performance, while stain
augmentation or stain adversarial methods demonstrated improved performance,
with the best performance consistently achieved by our proposed approach. The
code is available at: https://github.com/mlyg/stain_consistency_learning
- Abstract(参考訳): Stain variationは、デジタル病理の自動解析にまつわるユニークな課題である。
機械学習手法の頑健性を改善するために多くの方法が開発されているが、比較研究は性能に限定的な利点を示している。
さらに, H&E染色データに対して, 分類タスクに限定して, 染色変化の処理方法が開発された。
本稿では,染色色不変特徴を学習するために,染色特異的増強と染色一貫性損失関数を組み合わせた新しい枠組みである染色一貫性学習を提案する。
セグメンテーションタスクにおける染色変化に対処する方法について,まず第1回,広範な比較を行い,マッソンのトリクロムとh&e染色セルと核データセットについてそれぞれ10の方法を比較した。
染色の正常化法では同等か劣る性能が得られたが, 染色増補法や染色逆行法では性能が向上し, 提案手法により一貫して最高の性能が得られた。
コードは、https://github.com/mlyg/stain_consistency_learningで入手できる。
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