論文の概要: Deep Neural Network Identification of Limnonectes Species and New Class
Detection Using Image Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.08661v1
- Date: Wed, 15 Nov 2023 02:57:59 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-16 17:26:49.101377
- Title: Deep Neural Network Identification of Limnonectes Species and New Class
Detection Using Image Data
- Title(参考訳): 深層ニューラルネットワークによるリムノネクトの同定と画像データを用いた新しいクラス検出
- Authors: Li Xu, Yili Hong, Eric P. Smith, David S. McLeod, Xinwei Deng, Laura
J. Freeman
- Abstract要約: ディープニューラルネットワークは、画像の分類を訓練された既知の種グループに分類することに成功した。
このアルゴリズムは,既存のクラスに属さない場合には,イメージを新しいクラスに分類できることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.943822554753426
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: As is true of many complex tasks, the work of discovering, describing, and
understanding the diversity of life on Earth (viz., biological systematics and
taxonomy) requires many tools. Some of this work can be accomplished as it has
been done in the past, but some aspects present us with challenges which
traditional knowledge and tools cannot adequately resolve. One such challenge
is presented by species complexes in which the morphological similarities among
the group members make it difficult to reliably identify known species and
detect new ones. We address this challenge by developing new tools using the
principles of machine learning to resolve two specific questions related to
species complexes. The first question is formulated as a classification problem
in statistics and machine learning and the second question is an
out-of-distribution (OOD) detection problem. We apply these tools to a species
complex comprising Southeast Asian stream frogs (Limnonectes kuhlii complex)
and employ a morphological character (hind limb skin texture) traditionally
treated qualitatively in a quantitative and objective manner. We demonstrate
that deep neural networks can successfully automate the classification of an
image into a known species group for which it has been trained. We further
demonstrate that the algorithm can successfully classify an image into a new
class if the image does not belong to the existing classes. Additionally, we
use the larger MNIST dataset to test the performance of our OOD detection
algorithm. We finish our paper with some concluding remarks regarding the
application of these methods to species complexes and our efforts to document
true biodiversity. This paper has online supplementary materials.
- Abstract(参考訳): 多くの複雑なタスクで当てはまるように、地球上の生命の多様性を発見し、記述し、理解する作業(生物系統学と分類学)には多くの道具が必要である。
この仕事のいくつかは、過去になされたように達成できますが、いくつかの側面は、伝統的な知識やツールが十分に解決できない課題をもたらしてくれます。
このような課題の1つは、グループメンバー間の形態的類似性が既知の種を確実に同定し、新しい種を検出するのを困難にする種複合体によって示される。
この課題は、機械学習の原理を用いて、種複合体に関連する2つの特定の問題を解決する新しいツールを開発することで解決される。
第1の質問は統計と機械学習の分類問題として定式化され、第2の質問はout-of-distribution (ood) detection問題である。
東南アジアのカエル(Limnonectes kuhlii complex)からなる種群にこれらのツールを適用し,伝統的に質的に定量的かつ客観的に処理された形態的特徴(下肢皮膚のテクスチャ)を用いる。
深層ニューラルネットワークは、画像が訓練された既知の種群への分類をうまく自動化できることを実証する。
さらに,既存のクラスに属さない場合には,アルゴリズムが画像を新しいクラスに分類できることを示す。
さらに、より大きなMNISTデータセットを使用して、OOD検出アルゴリズムの性能をテストする。
本論文は,本手法の生物複合体への応用と生物多様性の文書化に向けた取り組みについて考察した。
本論文はオンライン補足資料である。
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