論文の概要: Assessment of Deep Learning Segmentation for Real-Time Free-Breathing
Cardiac Magnetic Resonance Imaging at Rest and Under Exercise Stress
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.14049v4
- Date: Fri, 9 Feb 2024 14:03:52 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-02-12 20:08:29.291108
- Title: Assessment of Deep Learning Segmentation for Real-Time Free-Breathing
Cardiac Magnetic Resonance Imaging at Rest and Under Exercise Stress
- Title(参考訳): 安静時および運動負荷時のリアルタイム自由呼吸心磁気共鳴イメージングのためのディープラーニングセグメントの評価
- Authors: Martin Schilling and Christina Unterberg-Buchwald and Joachim Lotz and
Martin Uecker
- Abstract要約: 心臓MRI(CMR)セグメンテーションのために設計された、あるいは訓練されたディープラーニング手法は、リアルタイムCMRでよく機能する。
リアルタイムな自由呼吸型CMRでは、ディープラーニングメソッドのパフォーマンスは、cine CMRのサーバ間変動に匹敵する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.359557447960552
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In recent years, a variety of deep learning networks for cardiac MRI (CMR)
segmentation have been developed and analyzed. However, nearly all of them are
focused on cine CMR under breathold. In this work, accuracy of deep learning
methods is assessed for volumetric analysis (via segmentation) of the left
ventricle in real-time free-breathing CMR at rest and under exercise stress.
Data from healthy volunteers (n=15) for cine and real-time free-breathing CMR
at rest and under exercise stress were analyzed retrospectively. Segmentations
of a commercial software (comDL) and a freely available neural network
(nnU-Net), were compared to a reference created via the manual correction of
comDL segmentation. Segmentation of left ventricular endocardium (LV), left
ventricular myocardium (MYO), and right ventricle (RV) is evaluated for both
end-systolic and end-diastolic phases and analyzed with Dice's coefficient
(DC). The volumetric analysis includes LV end-diastolic volume (EDV), LV
end-systolic volume (ESV), and LV ejection fraction (EF). For cine CMR, nnU-Net
and comDL achieve a DC above 0.95 for LV and 0.9 for MYO, and RV. For real-time
CMR, the accuracy of nnU-Net exceeds that of comDL overall. For real-time CMR
at rest, nnU-Net achieves a DC of 0.94 for LV, 0.89 for MYO, and 0.90 for RV;
mean absolute differences between nnU-Net and reference are 2.9mL for EDV,
3.5mL for ESV and 2.6% for EF. For real-time CMR under exercise stress, nnU-Net
achieves a DC of 0.92 for LV, 0.85 for MYO, and 0.83 for RV; mean absolute
differences between nnU-Net and reference are 11.4mL for EDV, 2.9mL for ESV and
3.6% for EF. Deep learning methods designed or trained for cine CMR
segmentation can perform well on real-time CMR. For real-time free-breathing
CMR at rest, the performance of deep learning methods is comparable to
inter-observer variability in cine CMR and is usable or fully automatic
segmentation.
- Abstract(参考訳): 近年、心臓MRI(CMR)セグメンテーションのための様々なディープラーニングネットワークが開発され、分析されている。
しかし、ほとんど全員が呼吸中のシネCMRに焦点を当てている。
本研究は、安静時および運動負荷時のリアルタイム自由呼吸cmrにおける左室容積分析(セグメンテーション)において、深部学習法の精度を評価した。
健康なボランティア(n=15)のシネおよび運動負荷下でのリアルタイム自由呼吸cmrのデータをふりかえり分析した。
商用ソフトウェア(comDL)と利用可能なニューラルネットワーク(nnU-Net)のセグメンテーションを、comDLセグメンテーションのマニュアル修正によって作成されたリファレンスと比較した。
左室心内膜(lv)、左室心筋(myo)、右室(rv)のセグメンテーションは、末期収縮期と末期拡張期の両方において評価され、dice係数(dc)を用いて解析された。
ボリューム分析は、LV端収縮体積(EDV)、LV端収縮体積(ESV)、LV放出率(EF)を含む。
cine cmr では、nnu-net と comdl は lv が 0.95 以上、myo と rv が 0.9 以上となる。
リアルタイムCMRでは, nnU-Net の精度が comDL の精度を上回っている。
リアルタイムCMRでは、nnU-NetはLVが0.94、MYOが0.89、RVが0.90、EDVが2.9mL、ESVが3.5mL、EFが2.6%である。
運動ストレス下でのリアルタイムCMRでは、nnU-Netは、LVが0.92、MYOが0.85、RVが0.83、EDVが11.4mL、ESVが2.9mL、EFが3.6%である。
シネCMRセグメンテーションのために設計または訓練されたディープラーニング手法は、リアルタイムCMRでよく機能する。
リアルタイムのフリーブレスCMRでは、ディープラーニングメソッドのパフォーマンスは、cine CMRのサーバ間変動と同等であり、使用可能なか、完全に自動セグメンテーションである。
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