論文の概要: Automated 3D Tumor Segmentation using Temporal Cubic PatchGAN (TCuP-GAN)
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.14148v1
- Date: Thu, 23 Nov 2023 18:37:26 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-27 16:41:25.195215
- Title: Automated 3D Tumor Segmentation using Temporal Cubic PatchGAN (TCuP-GAN)
- Title(参考訳): 経時的立方体PatchGAN(TCuP-GAN)を用いた3次元腫瘍切除
- Authors: Kameswara Bharadwaj Mantha, Ramanakumar Sankar, Lucy Fortson
- Abstract要約: テンポラルキューブPatchGAN(TCuP-GAN)は、畳み込み長短期記憶ネットワーク(LSTM)を用いた生成的特徴学習フレームワークの概念を結合したボリューム・ツー・ボリューム翻訳モデルである。
われわれは,4つのセグメンテーション課題 (Adult Glioma, Meningioma, Pediatric tumors, Sub-Saharan Africa) のデータに基づくTCuP-GANの有用性を実証した。
すべての課題にまたがって、堅牢なマルチクラスセグメンテーションマスクを予測するために、我々のフレームワークが成功したことを実証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.276240219662896
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Development of robust general purpose 3D segmentation frameworks using the
latest deep learning techniques is one of the active topics in various
bio-medical domains. In this work, we introduce Temporal Cubic PatchGAN
(TCuP-GAN), a volume-to-volume translational model that marries the concepts of
a generative feature learning framework with Convolutional Long Short-Term
Memory Networks (LSTMs), for the task of 3D segmentation. We demonstrate the
capabilities of our TCuP-GAN on the data from four segmentation challenges
(Adult Glioma, Meningioma, Pediatric Tumors, and Sub-Saharan Africa subset)
featured within the 2023 Brain Tumor Segmentation (BraTS) Challenge and
quantify its performance using LesionWise Dice similarity and $95\%$ Hausdorff
Distance metrics. We demonstrate the successful learning of our framework to
predict robust multi-class segmentation masks across all the challenges. This
benchmarking work serves as a stepping stone for future efforts towards
applying TCuP-GAN on other multi-class tasks such as multi-organelle
segmentation in electron microscopy imaging.
- Abstract(参考訳): 最新の深層学習技術を用いた堅牢な汎用3Dセグメンテーションフレームワークの開発は,様々なバイオメディカル領域において活発な話題の1つである。
本研究では,3次元セグメンテーションの課題に対して,畳み込み長短期記憶ネットワーク(LSTM)を用いた生成的特徴学習フレームワークの概念をマージするボリューム・ツー・ボリューム翻訳モデルであるテンポラルキュービック・パッチGAN(TCuP-GAN)を紹介する。
われわれは2023年のBrain tumor Segmentation (BraTS) Challengeで紹介された4つのセグメンテーション課題(Adult Glioma, Meningioma, Pediatric tumors, Sub-Saharan Africa subset)のデータに基づいてTCuP-GANの能力を実証し、LesionWise Dice類似度と95%のHausdorff Distance測定値を用いてその性能を定量化する。
我々は,すべての課題に対してロバストなマルチクラスセグメンテーションマスクを予測するためのフレームワークの学習を成功させた。
このベンチマーク作業は、将来TCuP-GANを電子顕微鏡イメージングにおける多臓器分割のような他のマルチクラスタスクに適用するための足掛かりとなる。
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