論文の概要: Dynamic Retrieval Augmented Generation of Ontologies using Artificial Intelligence (DRAGON-AI)
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2312.10904v2
- Date: Wed, 12 Jun 2024 17:15:37 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-06-13 23:13:33.921304
- Title: Dynamic Retrieval Augmented Generation of Ontologies using Artificial Intelligence (DRAGON-AI)
- Title（参考訳）: 人工知能(DRAGON-AI)を用いた動的検索オントロジー生成
- Authors: Sabrina Toro, Anna V Anagnostopoulos, Sue Bello, Kai Blumberg, Rhiannon Cameron, Leigh Carmody, Alexander D Diehl, Damion Dooley, William Duncan, Petra Fey, Pascale Gaudet, Nomi L Harris, Marcin Joachimiak, Leila Kiani, Tiago Lubiana, Monica C Munoz-Torres, Shawn O'Neil, David Osumi-Sutherland, Aleix Puig, Justin P Reese, Leonore Reiser, Sofia Robb, Troy Ruemping, James Seager, Eric Sid, Ray Stefancsik, Magalie Weber, Valerie Wood, Melissa A Haendel, Christopher J Mungall,
- Abstract要約: AI(DRAGON-AI)を用いた動的検索オントロジー生成を提案する。
DRAGON-AIは、既存のインストラクションや構造化されていないテキストソースから、テキストおよび論理的なコンポーネントを生成することができる。
DRAGON-AIの自然言語をGitHubのイシューに組み込む能力についても実証した。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 24.433048676289363
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Background: Ontologies are fundamental components of informatics infrastructure in domains such as biomedical, environmental, and food sciences, representing consensus knowledge in an accurate and computable form. However, their construction and maintenance demand substantial resources and necessitate substantial collaboration between domain experts, curators, and ontology experts. We present Dynamic Retrieval Augmented Generation of Ontologies using AI (DRAGON-AI), an ontology generation method employing Large Language Models (LLMs) and Retrieval Augmented Generation (RAG). DRAGON-AI can generate textual and logical ontology components, drawing from existing knowledge in multiple ontologies and unstructured text sources. Results: We assessed performance of DRAGON-AI on de novo term construction across ten diverse ontologies, making use of extensive manual evaluation of results. Our method has high precision for relationship generation, but has slightly lower precision than from logic-based reasoning. Our method is also able to generate definitions deemed acceptable by expert evaluators, but these scored worse than human-authored definitions. Notably, evaluators with the highest level of confidence in a domain were better able to discern flaws in AI-generated definitions. We also demonstrated the ability of DRAGON-AI to incorporate natural language instructions in the form of GitHub issues. Conclusions: These findings suggest DRAGON-AI's potential to substantially aid the manual ontology construction process. However, our results also underscore the importance of having expert curators and ontology editors drive the ontology generation process.
- Abstract（参考訳）: 背景:オントロジーは、バイオメディカル、環境、食品科学といった分野における情報基盤の基本的な構成要素であり、正確で計算可能な形でのコンセンサス知識を表している。
しかし、その建設と維持にはかなりの資源が必要であり、ドメインの専門家、キュレーター、オントロジーの専門家の間でかなりの協力を必要としている。
本稿では,Large Language Models (LLM) とRetrieval Augmented Generation (RAG) を用いたオントロジー生成手法であるAI (DRAGON-AI) を用いた動的検索用拡張オントロジー生成について述べる。
DRAGON-AIは、複数のオントロジーおよび非構造化テキストソースにおける既存の知識から、テキストおよび論理オントロジーコンポーネントを生成することができる。
結果:10のオントロジーにまたがるドノボ項構築におけるDRAGON-AIの有効性を評価し,広範囲な手作業による評価を行った。
本手法は関係生成の精度が高いが,論理に基づく推論よりも若干精度が低い。
また,本手法は,専門家評価者によって受け入れられていると考えられる定義を生成することができるが,人間による定義よりも評価が劣る。
特に、ドメインに最も信頼度の高い評価者は、AIが生成した定義の欠陥をよりよく識別することができた。
GitHubイシューの形で自然言語命令を組み込むDRAGON-AIの能力を実証した。
結論: DRAGON-AIが手動オントロジー構築プロセスに有効である可能性が示唆された。
しかし,本研究の結果は,専門家のキュレーターやオントロジーの編集者がオントロジー生成過程を推し進めることの重要性も浮き彫りにしている。
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