論文の概要: GenoCraft: A Comprehensive, User-Friendly Web-Based Platform for High-Throughput Omics Data Analysis and Visualization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2312.14249v3
- Date: Fri, 15 Nov 2024 14:49:21 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-18 18:55:24.815697
- Title: GenoCraft: A Comprehensive, User-Friendly Web-Based Platform for High-Throughput Omics Data Analysis and Visualization
- Title（参考訳）: GenoCraft: 高スループットオミクスデータ分析と可視化のための総合的でユーザフレンドリーなWebベースプラットフォーム
- Authors: Yingzhou Lu, Minjie Shen, Ling Yue, Chenhao Li, Lulu Chen, Fan Meng, Xiao Wang, David Herrington, Yue Wang, Yue Zhao, Tianfan Fu, Capucine Van Rechem,
- Abstract要約: GenoCraftは、オミクスデータ処理のパイプライン全体を扱うように設計された、Webベースの包括的なソフトウェアソリューションである。
GenoCraftは高度なバイオインフォマティクスツールを備えた統一プラットフォームを提供し、オミクスデータ分析のあらゆる側面をカバーする。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 23.53674358126236
- License:
- Abstract: The surge in high-throughput omics data has reshaped the landscape of biological research, underlining the need for powerful, user-friendly data analysis and interpretation tools. This paper presents GenoCraft, a web-based comprehensive software solution designed to handle the entire pipeline of omics data processing. GenoCraft offers a unified platform featuring advanced bioinformatics tools, covering all aspects of omics data analysis. It encompasses a range of functionalities, such as normalization, quality control, differential analysis, network analysis, pathway analysis, and diverse visualization techniques. This software makes state-of-the-art omics data analysis more accessible to a wider range of users. With GenoCraft, researchers and data scientists have access to an array of cutting-edge bioinformatics tools under a user-friendly interface, making it a valuable resource for managing and analyzing large-scale omics data. The API with an interactive web interface is publicly available at https://genocraft.stanford. edu/. We also release all the codes in https://github.com/futianfan/GenoCraft.
- Abstract（参考訳）: 高スループットのオミクスデータの急増は、生物学的研究の風景を変え、強力でユーザフレンドリなデータ分析と解釈ツールの必要性を浮き彫りにした。
本稿では、オミクスデータ処理のパイプライン全体を扱うように設計されたWebベースの包括的ソフトウェアソリューションであるGenoCraftについて述べる。
GenoCraftは高度なバイオインフォマティクスツールを備えた統一プラットフォームを提供し、オミクスデータ分析のあらゆる側面をカバーする。
正規化、品質制御、差分解析、ネットワーク分析、経路解析、多様な可視化技術など、様々な機能を含んでいる。
このソフトウェアは、最先端のオミクスデータ分析を、より広い範囲のユーザにとってよりアクセスしやすいものにします。
GenoCraftでは、研究者やデータサイエンティストが、ユーザフレンドリーなインターフェースの下で、最先端のバイオインフォマティクスツールにアクセスでき、大規模なオミクスデータを管理し分析するための貴重なリソースとなる。
インタラクティブなWebインターフェースを備えたAPIはhttps://genocraft.stanford.comで公開されている。
edu/。
また、すべてのコードをhttps://github.com/futianfan/GenoCraft.comでリリースしています。
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