論文の概要: Exploring the Effectiveness of Instruction Tuning in Biomedical Language
Processing
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2401.00579v1
- Date: Sun, 31 Dec 2023 20:02:10 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-01-03 16:43:24.724261
- Title: Exploring the Effectiveness of Instruction Tuning in Biomedical Language
Processing
- Title(参考訳): バイオメディカル言語処理におけるインストラクションチューニングの効果を探る
- Authors: Omid Rohanian, Mohammadmahdi Nouriborji, David A. Clifton
- Abstract要約: 本研究では,バイオメディカル言語処理における指導指導の可能性について検討する。
約20,000ドルのインストラクション中心のサンプルからなるデータセットで訓練された包括的,命令ベースのモデルを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 19.41164870575055
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Large Language Models (LLMs), particularly those similar to ChatGPT, have
significantly influenced the field of Natural Language Processing (NLP). While
these models excel in general language tasks, their performance in
domain-specific downstream tasks such as biomedical and clinical Named Entity
Recognition (NER), Relation Extraction (RE), and Medical Natural Language
Inference (NLI) is still evolving. In this context, our study investigates the
potential of instruction tuning for biomedical language processing, applying
this technique to two general LLMs of substantial scale. We present a
comprehensive, instruction-based model trained on a dataset that consists of
approximately $200,000$ instruction-focused samples. This dataset represents a
carefully curated compilation of existing data, meticulously adapted and
reformatted to align with the specific requirements of our instruction-based
tasks. This initiative represents an important step in utilising such models to
achieve results on par with specialised encoder-only models like BioBERT and
BioClinicalBERT for various classical biomedical NLP tasks. Our work includes
an analysis of the dataset's composition and its impact on model performance,
providing insights into the intricacies of instruction tuning. By sharing our
codes, models, and the distinctively assembled instruction-based dataset, we
seek to encourage ongoing research and development in this area.
- Abstract(参考訳): 大規模言語モデル(LLM)、特にChatGPTに類似するものは、自然言語処理(NLP)の分野に大きな影響を与えている。
これらのモデルは一般的な言語タスクで優れているが、生物医学的および臨床的な名前付きエンティティ認識(ner)、関係抽出(re)、医学的自然言語推論(nli)といったドメイン固有の下流タスクのパフォーマンスはまだ進化を続けている。
本研究は,バイオメディカル言語処理における指導指導の可能性について検討し,本手法を大規模2つのLLMに適用した。
約200,000ドルの命令中心のサンプルからなるデータセット上でトレーニングされた包括的命令ベースモデルを提案する。
このデータセットは、命令ベースのタスクの特定の要求に合わせて慎重に適応し、修正された既存のデータの注意深くコンパイルされたコンパイルを表します。
このイニシアチブは、biobertやbioclinicalbertのような特殊なエンコーダのみのモデルと同等の結果を様々な古典的生物医学的nlpタスクに利用するための重要なステップである。
我々の研究は、データセットの構成とモデルパフォーマンスへの影響を分析し、命令チューニングの複雑さに関する洞察を提供する。
コード、モデル、および独自に構築された命令ベースのデータセットを共有することで、この分野の継続的な研究と開発を促進することを目指している。
関連論文リスト
- Pre-training data selection for biomedical domain adaptation using journal impact metrics [0.0]
我々は, PubMed トレーニングセットの各種サブセット上で, BERT を継続的に事前学習することにより, 雑誌のインパクト測定と実験を行う。
本研究の結果から,ジャーナルインパクトメトリクスを用いたプルーニングは効率的ではないことが示唆された。しかし,より少ない抽象度を用いた事前学習(ただし,同じ数のトレーニングステップで)は,必ずしも結果のモデルの性能を低下させるわけではない。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-09-04T13:59:48Z) - Medical Vision-Language Pre-Training for Brain Abnormalities [96.1408455065347]
本稿では,PubMedなどの公共リソースから,医用画像・テキスト・アライメントデータを自動的に収集する方法を示す。
特に,まず大きな脳画像テキストデータセットを収集することにより,事前学習プロセスの合理化を図るパイプラインを提案する。
また,医療領域におけるサブフィギュアをサブキャプションにマッピングするというユニークな課題についても検討した。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-04-27T05:03:42Z) - An Evaluation of Large Language Models in Bioinformatics Research [52.100233156012756]
本研究では,大規模言語モデル(LLM)の性能について,バイオインフォマティクスの幅広い課題について検討する。
これらのタスクには、潜在的なコーディング領域の同定、遺伝子とタンパク質の命名されたエンティティの抽出、抗微生物および抗がんペプチドの検出、分子最適化、教育生物情報学問題の解決が含まれる。
以上の結果から, GPT 変種のような LLM がこれらのタスクの多くをうまく処理できることが示唆された。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-02-21T11:27:31Z) - Diversifying Knowledge Enhancement of Biomedical Language Models using
Adapter Modules and Knowledge Graphs [54.223394825528665]
我々は、軽量なアダプターモジュールを用いて、構造化された生体医学的知識を事前訓練された言語モデルに注入するアプローチを開発した。
バイオメディカル知識システムUMLSと新しいバイオケミカルOntoChemの2つの大きなKGと、PubMedBERTとBioLinkBERTの2つの著名なバイオメディカルPLMを使用している。
計算能力の要件を低く保ちながら,本手法がいくつかの事例において性能改善につながることを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-12-21T14:26:57Z) - UMLS-KGI-BERT: Data-Centric Knowledge Integration in Transformers for
Biomedical Entity Recognition [4.865221751784403]
この研究は、UMLSからテキストシーケンスを抽出することにより、バイオメディカルトランスフォーマーエンコーダLMの言語表現を強化するためのデータ中心パラダイムに寄与する。
予め訓練したLMの拡張およびスクラッチからのトレーニングによる実験の結果から,複数の生物医学的,臨床的な名前付きエンティティ認識(NER)タスクにおける下流性能の向上が示された。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-07-20T18:08:34Z) - Interpretable Medical Diagnostics with Structured Data Extraction by
Large Language Models [59.89454513692417]
タブラルデータはしばしばテキストに隠され、特に医学的診断報告に使用される。
本稿では,TEMED-LLM と呼ばれるテキスト医療報告から構造化表状データを抽出する手法を提案する。
本手法は,医学診断における最先端のテキスト分類モデルよりも優れていることを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-06-08T09:12:28Z) - An Iterative Optimizing Framework for Radiology Report Summarization with ChatGPT [80.33783969507458]
放射線医学報告の「印象」セクションは、放射線医と他の医師とのコミュニケーションにとって重要な基盤である。
近年の研究では、大規模医療用テキストデータを用いた印象自動生成の有望な成果が得られている。
これらのモデルは、しばしば大量の医療用テキストデータを必要とし、一般化性能が劣る。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-04-17T17:13:42Z) - BigBIO: A Framework for Data-Centric Biomedical Natural Language
Processing [13.30221348538759]
バイオメディカルNLPデータセット126以上のコミュニティライブラリであるBigBIOを紹介する。
BigBIOは、データセットとそのメタデータへのプログラムアクセスを通じて、再現可能なメタデータキュレーションを容易にする。
本稿では,タスクスキーマ,データ監査,コントリビューションガイドライン,および2つの実証的ユースケースの概要について論じる。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-06-30T07:15:45Z) - PharmKE: Knowledge Extraction Platform for Pharmaceutical Texts using
Transfer Learning [0.0]
PharmKEは、医薬品のセマンティック分析を徹底するために、いくつかの段階を通じてディープラーニングを適用するテキスト分析プラットフォームです。
この方法論は、正確なラベル付きトレーニングとテストデータセットの作成に使用され、カスタムエンティティラベリングタスクのモデルトレーニングに使用されます。
得られた結果は、同じデータセットで訓練された微調整BERTおよびBioBERTモデルと比較されます。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-02-25T19:36:35Z) - Domain-Specific Language Model Pretraining for Biomedical Natural
Language Processing [73.37262264915739]
バイオメディシンなどのラベルなしテキストの少ないドメインでは、スクラッチから言語モデルを事前学習することで、かなりの利益が得られることを示す。
実験の結果, ドメイン固有のプレトレーニングは, 幅広い生物医学的NLPタスクの基盤となることが明らかとなった。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-07-31T00:04:15Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。