論文の概要: Brain Tumor Radiogenomic Classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2401.09471v1
- Date: Thu, 11 Jan 2024 10:30:09 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-01-22 09:15:03.139887
- Title: Brain Tumor Radiogenomic Classification
- Title(参考訳): 脳腫瘍放射線ゲノム分類
- Authors: Amr Mohamed, Mahmoud Rabea, Aya Sameh, Ehab Kamal
- Abstract要約: 2次分類によるグリオ芽腫のMGMTバイオマーカー状態の予測を目的としたRSNA-MICCAI脳腫瘍ラジオゲノミクス分類の試み
データセットはトレーニングセット、トレーニング中に使用された検証セット、最終評価時にのみ使用されるテストの3つの主要なコホートに分割される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.8276368987462532
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: The RSNA-MICCAI brain tumor radiogenomic classification challenge aimed to
predict MGMT biomarker status in glioblastoma through binary classification on
Multi parameter mpMRI scans: T1w, T1wCE, T2w and FLAIR. The dataset is splitted
into three main cohorts: training set, validation set which were used during
training, and the testing were only used during final evaluation. Images were
either in a DICOM format or in Png format. different architectures were used to
investigate the problem including the 3D version of Vision Transformer (ViT3D),
ResNet50, Xception and EfficientNet-B3. AUC was used as the main evaluation
metric and the results showed an advantage for both the ViT3D and the Xception
models achieving 0.6015 and 0.61745 respectively on the testing set. compared
to other results, our results proved to be valid given the complexity of the
task. further improvements can be made through exploring different strategies,
different architectures and more diverse datasets.
- Abstract(参考訳): T1w, T1wCE, T1wCE, T2w, FLAIRの2値分類により, グリオ芽腫におけるMGMTバイオマーカーの診断を目的としたRSNA-MICCAI脳腫瘍放射線ゲノム分類の試みを行った。
データセットはトレーニングセット、トレーニング中に使用された検証セット、最終評価時にのみ使用されるテストの3つの主要なコホートに分割される。
画像はDICOMフォーマットかPngフォーマットであった。
Vision Transformer (ViT3D) の3Dバージョン、ResNet50、Xception、EfficientNet-B3など、様々なアーキテクチャがこの問題を調査した。
AUCを主評価基準として使用し、テストセットでそれぞれ0.6015と0.61745を達成したViT3DとXceptionモデルの両方に利点を示した。
他の結果と比較すると, 作業の複雑さを考えると, 結果は有効であることが判明した。
さまざまな戦略、異なるアーキテクチャ、より多様なデータセットを探索することで、さらなる改善が可能になる。
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