論文の概要: PubTator 3.0: an AI-powered Literature Resource for Unlocking Biomedical Knowledge

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2401.11048v1
• Date: Fri, 19 Jan 2024 22:24:39 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2024-01-23 18:18:46.671779
• Title: PubTator 3.0: an AI-powered Literature Resource for Unlocking Biomedical Knowledge
• Title（参考訳）: pubtator 3.0: 生物医学知識の解錠のためのaiによる文献リソース
• Authors: Chih-Hsuan Wei, Alexis Allot, Po-Ting Lai, Robert Leaman, Shubo Tian, Ling Luo, Qiao Jin, Zhizheng Wang, Qingyu Chen, and Zhiyong Lu
• Abstract要約: PubTator 3.0は、最先端のAI技術を使用して意味と関係を検索するバイオメディカル文献リソースである。 現在、約3600万のPubMed抽象化と600万のフルテキスト記事に対して、10億以上のエンティティとリレーショナルアノテーションを提供している。 PubTator 3.0では、PubMedやGoogle Scholarよりも多くの記事が検索され、上位20項目の精度が高いことが示されています。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 7.483612362757038
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: PubTator 3.0 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/pubtator3/) is a biomedical literature resource using state-of-the-art AI techniques to offer semantic and relation searches for key concepts like proteins, genetic variants, diseases, and chemicals. It currently provides over one billion entity and relation annotations across approximately 36 million PubMed abstracts and 6 million full-text articles from the PMC open access subset, updated weekly. PubTator 3.0's online interface and API utilize these precomputed entity relations and synonyms to provide advanced search capabilities and enable large-scale analyses, streamlining many complex information needs. We showcase the retrieval quality of PubTator 3.0 using a series of entity pair queries, demonstrating that PubTator 3.0 retrieves a greater number of articles than either PubMed or Google Scholar, with higher precision in the top 20 results. We further show that integrating ChatGPT (GPT-4) with PubTator APIs dramatically improves the factuality and verifiability of its responses. In summary, PubTator 3.0 offers a comprehensive set of features and tools that allow researchers to navigate the ever-expanding wealth of biomedical literature, expediting research and unlocking valuable insights for scientific discovery.
• Abstract（参考訳）: pubtator 3.0 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/pubtator3/)は、最新のai技術を用いて、タンパク質、遺伝子変異、疾患、化学物質といった重要な概念に関する意味的および関連検索を提供する、生物医学文献のリソースである。 現在、約3600万のpubmed抽象化と、pmc open accessサブセットから600万のフルテキスト記事に対して、10億以上のエンティティと関係アノテーションを提供している。 pubtator 3.0のオンラインインターフェースとapiは、これらの事前計算されたエンティティリレーションとシノニムを使用して、高度な検索機能を提供し、複雑な情報のニーズを合理化する大規模な分析を可能にする。 本稿では,PubTator 3.0がPubMedやGoogle Scholarよりも多くの項目を検索し,上位20項目で高い精度で検索できることを示す。 さらに,ChatGPT(GPT-4)とPubTator APIを統合することで,応答の事実性と妥当性が劇的に向上することを示す。 まとめると、PubTator 3.0は、研究者が生医学の豊富な文献をナビゲートし、研究を迅速化し、科学的発見のための貴重な洞察を解放する、包括的な機能とツールセットを提供する。

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