論文の概要: Biomedical Entity Linking as Multiple Choice Question Answering
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2402.15189v2
- Date: Fri, 17 May 2024 09:11:44 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-05-20 18:31:55.310910
- Title: Biomedical Entity Linking as Multiple Choice Question Answering
- Title(参考訳): 複数質問応答としてのバイオメディカルエンティティリンク
- Authors: Zhenxi Lin, Ziheng Zhang, Xian Wu, Yefeng Zheng,
- Abstract要約: 本稿では,バイオメディカルエンティティリンクを複数問合せ回答として扱う新モデルであるBioELQAを提案する。
まず、高速検索器を用いて候補エンティティを取得し、生成器に参照と候補エンティティを共同で提示し、選択したエンティティに関連付けられた予測シンボルを出力する。
長い尾を持つエンティティの一般化を改善するため、類似したラベル付きトレーニングインスタンスを手がかりとして検索し、ジェネレータの検索インスタンスで入力する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 48.74212158495695
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Although biomedical entity linking (BioEL) has made significant progress with pre-trained language models, challenges still exist for fine-grained and long-tailed entities. To address these challenges, we present BioELQA, a novel model that treats Biomedical Entity Linking as Multiple Choice Question Answering. BioELQA first obtains candidate entities with a fast retriever, jointly presents the mention and candidate entities to a generator, and then outputs the predicted symbol associated with its chosen entity. This formulation enables explicit comparison of different candidate entities, thus capturing fine-grained interactions between mentions and entities, as well as among entities themselves. To improve generalization for long-tailed entities, we retrieve similar labeled training instances as clues and concatenate the input with retrieved instances for the generator. Extensive experimental results show that BioELQA outperforms state-of-the-art baselines on several datasets.
- Abstract(参考訳): バイオメディカル・エンティティ・リンク(BioEL)は、事前訓練された言語モデルにおいて大きな進歩を遂げてきたが、細粒度と長い尾のエンティティには依然として課題がある。
これらの課題に対処するために,BioELQAという,バイオメディカルエンティティリンクを複数問合せ回答として扱う新しいモデルを提案する。
BioELQAはまず、高速検索器で候補エンティティを取得し、参照と候補エンティティを共同でジェネレータに提示し、選択したエンティティに関連する予測シンボルを出力する。
この定式化は、異なる候補エンティティの明示的な比較を可能にするため、参照とエンティティ間のきめ細かい相互作用を、エンティティ自身と同様にキャプチャする。
長い尾を持つエンティティの一般化を改善するため、類似したラベル付きトレーニングインスタンスを手がかりとして検索し、取得したインスタンスとジェネレータの入力を結合する。
大規模な実験結果から、BioELQAはいくつかのデータセットで最先端のベースラインを上回ります。
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