論文の概要: Spatiotemporal Representation Learning for Short and Long Medical Image Time Series
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.07513v2
- Date: Sun, 27 Oct 2024 02:56:00 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-10-29 12:14:04.200726
- Title: Spatiotemporal Representation Learning for Short and Long Medical Image Time Series
- Title(参考訳): 短期的・長期的医用画像時系列の時空間表現学習
- Authors: Chengzhi Shen, Martin J. Menten, Hrvoje Bogunović, Ursula Schmidt-Erfurth, Hendrik Scholl, Sobha Sivaprasad, Andrew Lotery, Daniel Rueckert, Paul Hager, Robbie Holland,
- Abstract要約: 時間的発達の分析は多くの医療条件の正確な予後に不可欠である。
数ヶ月または数年にわたって起こる長期の発達を追跡することは、正確な予後に不可欠である。
短期的・長期的分析と臨床的意思決定の両方の重要性にもかかわらず、彼らは医学的深層学習において過小評価されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.344657414044153
- License:
- Abstract: Analyzing temporal developments is crucial for the accurate prognosis of many medical conditions. Temporal changes that occur over short time scales are key to assessing the health of physiological functions, such as the cardiac cycle. Moreover, tracking longer term developments that occur over months or years in evolving processes, such as age-related macular degeneration (AMD), is essential for accurate prognosis. Despite the importance of both short and long term analysis to clinical decision making, they remain understudied in medical deep learning. State of the art methods for spatiotemporal representation learning, developed for short natural videos, prioritize the detection of temporal constants rather than temporal developments. Moreover, they do not account for varying time intervals between acquisitions, which are essential for contextualizing observed changes. To address these issues, we propose two approaches. First, we combine clip-level contrastive learning with a novel temporal embedding to adapt to irregular time series. Second, we propose masking and predicting latent frame representations of the temporal sequence. Our two approaches outperform all prior methods on temporally-dependent tasks including cardiac output estimation and three prognostic AMD tasks. Overall, this enables the automated analysis of temporal patterns which are typically overlooked in applications of deep learning to medicine.
- Abstract(参考訳): 時間的発達の分析は多くの医療条件の正確な予後に不可欠である。
短時間のスケールで起こる一時的な変化は、心臓循環のような生理機能の健康を評価する鍵となる。
さらに、加齢関連黄斑変性(AMD)のような進化過程において、数ヶ月または数年にわたって起こる長期的発達の追跡は、正確な予後に不可欠である。
短期的・長期的分析が臨床的意思決定に重要であるにもかかわらず、医学的深層学習の分野ではまだ研究が続けられている。
短時間のナチュラルビデオのために開発された時空間表現学習の最先端技術は、時間的発達よりも時間的定数の検出を優先している。
さらに、観測された変化の文脈化に欠かせない買収間の時間間隔も考慮していない。
これらの問題に対処するため、我々は2つのアプローチを提案する。
まず、クリップレベルのコントラスト学習と新しい時間埋め込みを組み合わせることで、不規則な時系列に適応する。
次に、時間列の潜在フレーム表現のマスキングと予測を提案する。
心的出力推定と3つの予後AMDタスクを含む時間的依存タスクにおいて,2つのアプローチが従来手法よりも優れていた。
全体としては、ディープラーニングの医学への応用において一般的に見過ごされる時間パターンの自動分析を可能にする。
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