論文の概要: FocusMAE: Gallbladder Cancer Detection from Ultrasound Videos with Focused Masked Autoencoders
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.08848v1
- Date: Wed, 13 Mar 2024 16:57:04 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-16 00:41:28.781873
- Title: FocusMAE: Gallbladder Cancer Detection from Ultrasound Videos with Focused Masked Autoencoders
- Title(参考訳): FocusMAE:集束型オートエンコーダを用いた超音波による胆嚢癌検出
- Authors: Soumen Basu, Mayuna Gupta, Chetan Madan, Pankaj Gupta, Chetan Arora,
- Abstract要約: 超音波ソノグラフィー(US)画像を利用したSOTA法は,変換的アプローチの必要性を強調しつつ,限定的な一般化を示している。
本研究では,高情報領域からのマスキングトークンの選択を体系的にバイアスし,より洗練された悪性度表現を育成するFocusMAEという新しい設計を提案する。
我々は,現在の画像ベースSOTA-RadFormerで84%,ビデオベースSOTA-AdaMAEで94.7%,GBC検出問題で96.4%の最先端(SOTA)精度を報告した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.76606060260265
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: In recent years, automated Gallbladder Cancer (GBC) detection has gained the attention of researchers. Current state-of-the-art (SOTA) methodologies relying on ultrasound sonography (US) images exhibit limited generalization, emphasizing the need for transformative approaches. We observe that individual US frames may lack sufficient information to capture disease manifestation. This study advocates for a paradigm shift towards video-based GBC detection, leveraging the inherent advantages of spatiotemporal representations. Employing the Masked Autoencoder (MAE) for representation learning, we address shortcomings in conventional image-based methods. We propose a novel design called FocusMAE to systematically bias the selection of masking tokens from high-information regions, fostering a more refined representation of malignancy. Additionally, we contribute the most extensive US video dataset for GBC detection. We also note that, this is the first study on US video-based GBC detection. We validate the proposed methods on the curated dataset, and report a new state-of-the-art (SOTA) accuracy of 96.4% for the GBC detection problem, against an accuracy of 84% by current Image-based SOTA - GBCNet, and RadFormer, and 94.7% by Video-based SOTA - AdaMAE. We further demonstrate the generality of the proposed FocusMAE on a public CT-based Covid detection dataset, reporting an improvement in accuracy by 3.3% over current baselines. The source code and pretrained models are available at: https://github.com/sbasu276/FocusMAE.
- Abstract(参考訳): 近年,胆嚢癌(GBC)の自動検出が研究者の注目を集めている。
超音波ソノグラフィー(US)画像を利用したSOTA法は,変換的アプローチの必要性を強調しつつ,限定的な一般化を示している。
我々は、個々のアメリカのフレームには、病気の徴候を捉えるのに十分な情報がないことを観察する。
本研究は、時空間表現の固有の利点を生かして、ビデオベースGBC検出へのパラダイムシフトを提唱する。
Masked Autoencoder (MAE) を表現学習に適用し、従来の画像ベース手法の欠点に対処する。
本研究では,高情報領域からのマスキングトークンの選択を体系的にバイアスし,より洗練された悪性度表現を育成するFocusMAEという新しい設計を提案する。
さらに、GBC検出のための最も広範な米国ビデオデータセットをコントリビュートする。
また、これは米国におけるビデオベースのGBC検出に関する最初の研究である。
提案手法の有効性を検証し,既存の画像ベースSOTA - GBCNet と RadFormer では84%,ビデオベース SOTA - AdaMAE では94.7% の精度で,GBC 検出問題に対して96.4% の新たな最先端SOTA (State-of-the-art) 精度を報告した。
提案したFocusMAEの公共CTに基づくCovid検出データセットの汎用性をさらに実証し、現在のベースラインよりも精度が3.3%向上したことを報告した。
ソースコードと事前訓練されたモデルは、https://github.com/sbasu276/FocusMAE.comで入手できる。
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