論文の概要: Estimation and Analysis of Slice Propagation Uncertainty in 3D Anatomy Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.12290v1
- Date: Mon, 18 Mar 2024 22:26:19 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-20 18:02:18.196153
- Title: Estimation and Analysis of Slice Propagation Uncertainty in 3D Anatomy Segmentation
- Title(参考訳): 3次元解剖学的セグメンテーションにおけるスライス伝播不確かさの推定と解析
- Authors: Rachaell Nihalaani, Tushar Kataria, Jadie Adams, Shireen Y. Elhabian,
- Abstract要約: 3次元解剖学的セグメンテーションの監視手法は優れた性能を示すが、アノテートされたデータの可用性によって制限されることが多い。
この制限により、利用可能な無注釈データの豊富さと相まって、自己監督的なアプローチへの関心が高まっている。
スライス伝播は、スライス登録を自己監督のタスクとして活用し、最小限の監督で完全な解剖学的セグメンテーションを実現する自己監督のアプローチとして登場した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.791830972526084
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Supervised methods for 3D anatomy segmentation demonstrate superior performance but are often limited by the availability of annotated data. This limitation has led to a growing interest in self-supervised approaches in tandem with the abundance of available un-annotated data. Slice propagation has emerged as an self-supervised approach that leverages slice registration as a self-supervised task to achieve full anatomy segmentation with minimal supervision. This approach significantly reduces the need for domain expertise, time, and the cost associated with building fully annotated datasets required for training segmentation networks. However, this shift toward reduced supervision via deterministic networks raises concerns about the trustworthiness and reliability of predictions, especially when compared with more accurate supervised approaches. To address this concern, we propose the integration of calibrated uncertainty quantification (UQ) into slice propagation methods, providing insights into the model's predictive reliability and confidence levels. Incorporating uncertainty measures enhances user confidence in self-supervised approaches, thereby improving their practical applicability. We conducted experiments on three datasets for 3D abdominal segmentation using five UQ methods. The results illustrate that incorporating UQ improves not only model trustworthiness, but also segmentation accuracy. Furthermore, our analysis reveals various failure modes of slice propagation methods that might not be immediately apparent to end-users. This study opens up new research avenues to improve the accuracy and trustworthiness of slice propagation methods.
- Abstract(参考訳): 3次元解剖学的セグメンテーションの監視手法は優れた性能を示すが、アノテートされたデータの可用性によって制限されることが多い。
この制限により、利用可能な無注釈データの豊富さと相まって、自己監督的なアプローチへの関心が高まっている。
スライス伝播は、スライス登録を自己監督タスクとして活用し、最小限の監督で完全な解剖学的セグメンテーションを実現する自己監督的アプローチとして登場した。
このアプローチによって、ドメインの専門知識、時間、およびセグメンテーションネットワークのトレーニングに必要な完全なアノテーション付きデータセット構築に伴うコストが大幅に削減される。
しかし、この決定論的ネットワークによる監視の削減へのシフトは、特により正確な教師付きアプローチと比較して、予測の信頼性と信頼性に関する懸念を提起する。
この問題に対処するため,キャリブレーションされた不確実性定量化(UQ)をスライス伝播法に統合し,モデルの予測信頼性と信頼性レベルについて考察する。
不確実性対策を取り入れることで、自己管理アプローチに対するユーザの信頼感を高め、実用的な適用性を向上させる。
5つのUQ法を用いて3次元腹部分割のための3つのデータセットについて実験を行った。
その結果,UQの導入はモデルの信頼性だけでなくセグメンテーションの精度も向上することがわかった。
さらに, エンドユーザーにはすぐには明らかでないかもしれないスライス伝播手法の様々な障害モードを明らかにした。
本研究は,スライス伝播法の精度と信頼性を向上させるため,新しい研究手法を開拓する。
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